More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02831 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0263  integral membrane protein MviN  88.8 
 
 
527 aa  917    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02941  hypothetical protein  70.45 
 
 
526 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02831  hypothetical protein  100 
 
 
527 aa  1028    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02841  hypothetical protein  93.93 
 
 
527 aa  949    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0249  integral membrane protein MviN  41.97 
 
 
535 aa  364  3e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24771  hypothetical protein  40.48 
 
 
535 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0278  virulence factor MVIN-like  41.46 
 
 
535 aa  326  7e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1627  virulence factor MVIN-like  45.55 
 
 
535 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02881  hypothetical protein  46.05 
 
 
535 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03391  hypothetical protein  45.76 
 
 
535 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0314279  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2041  integral membrane protein MviN  39.57 
 
 
540 aa  302  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.418304  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1077  integral membrane protein MviN  37.64 
 
 
533 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1048  integral membrane protein MviN  37.64 
 
 
533 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  35.28 
 
 
538 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2723  integral membrane protein MviN  38.12 
 
 
539 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793041  normal  0.029084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0771  integral membrane protein MviN  35.67 
 
 
553 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2677  virulence factor MVIN-like  37.79 
 
 
534 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1765  integral membrane protein MviN  38.06 
 
 
540 aa  236  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.944825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
494 aa  146  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 
529 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  25.48 
 
 
529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  25.48 
 
 
555 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  24.78 
 
 
539 aa  130  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  26.57 
 
 
524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  26.34 
 
 
516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  24.54 
 
 
531 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
511 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  26.49 
 
 
517 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 
522 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 
526 aa  117  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  25.93 
 
 
511 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  24.55 
 
 
531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  26.29 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  27.02 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  25.64 
 
 
523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  24.84 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  25.77 
 
 
534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  25.13 
 
 
573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
533 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  24.73 
 
 
530 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  24.68 
 
 
530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  24.52 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.35 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.35 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  25.33 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.35 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  25.33 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  25.33 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  25.33 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  26.41 
 
 
556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.35 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  25.33 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 
511 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 
529 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  24.64 
 
 
512 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  24.64 
 
 
512 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
535 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0625  virulence factor MVIN family protein  23.8 
 
 
448 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.289297  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  25.76 
 
 
542 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  25.76 
 
 
511 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 
512 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  27.16 
 
 
517 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  22.61 
 
 
521 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  24.16 
 
 
512 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 
512 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  24.31 
 
 
517 aa  106  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  25.74 
 
 
511 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  25.13 
 
 
528 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 
515 aa  106  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  24.67 
 
 
524 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  25.54 
 
 
511 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  26.72 
 
 
517 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  25.98 
 
 
521 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  25.39 
 
 
526 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25.06 
 
 
521 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  23.59 
 
 
545 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  25.7 
 
 
513 aa  104  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.01 
 
 
613 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  24.61 
 
 
512 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  26.3 
 
 
513 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  22.33 
 
 
517 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  24.05 
 
 
522 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  25.31 
 
 
522 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  23.8 
 
 
521 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  25.18 
 
 
512 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 
512 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  24.74 
 
 
515 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  24.11 
 
 
519 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  23.66 
 
 
511 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  25.44 
 
 
519 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  23.03 
 
 
498 aa  100  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
516 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  25.35 
 
 
530 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1607  integral membrane protein MviN  26.39 
 
 
469 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.916233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>