More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1627 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_03391  hypothetical protein  95.51 
 
 
535 aa  809    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0314279  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1627  virulence factor MVIN-like  100 
 
 
535 aa  1030    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24771  hypothetical protein  47.29 
 
 
535 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0249  integral membrane protein MviN  46.8 
 
 
535 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02881  hypothetical protein  54.24 
 
 
535 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0278  virulence factor MVIN-like  46.24 
 
 
535 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0263  integral membrane protein MviN  45.55 
 
 
527 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2041  integral membrane protein MviN  43.69 
 
 
540 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.418304  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02941  hypothetical protein  43.8 
 
 
526 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  41.22 
 
 
538 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02841  hypothetical protein  43.38 
 
 
527 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1077  integral membrane protein MviN  41.5 
 
 
533 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1048  integral membrane protein MviN  41.31 
 
 
533 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02831  hypothetical protein  43.24 
 
 
527 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0771  integral membrane protein MviN  39.61 
 
 
553 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2723  integral membrane protein MviN  41.08 
 
 
539 aa  355  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793041  normal  0.029084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1765  integral membrane protein MviN  40.78 
 
 
540 aa  332  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.944825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2677  virulence factor MVIN-like  41 
 
 
534 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  28.01 
 
 
534 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 
512 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  24.72 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  25.19 
 
 
533 aa  140  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  26.79 
 
 
515 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  29.44 
 
 
524 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  26.09 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  26.79 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  29.14 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  25.86 
 
 
529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  27.42 
 
 
494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  26.55 
 
 
529 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  25.93 
 
 
530 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  26.55 
 
 
529 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  25.97 
 
 
530 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  26.55 
 
 
555 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  27.6 
 
 
522 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  24.61 
 
 
530 aa  123  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  25.24 
 
 
524 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  26.62 
 
 
573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  27.45 
 
 
511 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  25.26 
 
 
523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  23.75 
 
 
521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  24.62 
 
 
514 aa  120  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  26.4 
 
 
519 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  24.34 
 
 
534 aa  120  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
519 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  25.47 
 
 
523 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  27.25 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  24.09 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  24.89 
 
 
521 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  24.53 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  24.62 
 
 
517 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  25.44 
 
 
526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  26.23 
 
 
519 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  25.97 
 
 
528 aa  117  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.81 
 
 
522 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
521 aa  117  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  25.57 
 
 
498 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  26.58 
 
 
523 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  25.19 
 
 
517 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  25.19 
 
 
517 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  27.4 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  26.83 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  27.65 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  26.01 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  25.77 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  22.55 
 
 
528 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  27.72 
 
 
520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  27.31 
 
 
519 aa  113  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  26.01 
 
 
519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  25.26 
 
 
522 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  25.52 
 
 
525 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  24.51 
 
 
521 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  26.23 
 
 
519 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  27.7 
 
 
494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  25.41 
 
 
613 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  26.57 
 
 
521 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 
523 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  25 
 
 
545 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  25.67 
 
 
545 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
511 aa  110  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  23.44 
 
 
517 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  25.8 
 
 
513 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  27.52 
 
 
508 aa  109  1e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  27.05 
 
 
505 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  26.38 
 
 
518 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  26.32 
 
 
516 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  23.54 
 
 
521 aa  108  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  25.94 
 
 
495 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  25.81 
 
 
520 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  24.11 
 
 
526 aa  107  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  26.24 
 
 
519 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
511 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  25.66 
 
 
511 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>