144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1528 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1528  malate synthase  100 
 
 		 468 aa  971    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.339488  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1414  malate synthase  66.51 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0160844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2767  malate synthase  62.47 
 
 		 549 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2845  malate synthase  62.7 
 
 		 549 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0745518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2943  malate synthase  62.7 
 
 		 549 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0164424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1290  malate synthase  63.01 
 
 		 554 aa  568  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1483  malate synthase  63.13 
 
 		 549 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1245  malate synthase  64.1 
 
 		 555 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000965788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1238  malate synthase  63.37 
 
 		 575 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1275  malate synthase  64.58 
 
 		 544 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.412232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1307  malate synthase  63.13 
 
 		 549 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1343  malate synthase  63.37 
 
 		 549 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3043  malate synthase  63.37 
 
 		 549 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1316  malate synthase  63.13 
 
 		 549 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.304553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1101  malate synthase  62.77 
 
 		 550 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2381  malate synthase  61.32 
 
 		 543 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  52.74 
 
 		 542 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01041  malate synthase  52.27 
 
 		 544 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0294  malate synthase  53.07 
 
 		 532 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  53.07 
 
 		 532 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0364  malate synthase  53.07 
 
 		 532 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0266  malate synthase  52.33 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00405334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0365  malate synthase A  50.85 
 
 		 532 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3779  malate synthase  52.31 
 
 		 532 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4519  malate synthase  52.32 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.492257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4516  malate synthase  52.32 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.070236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4429  malate synthase  52.32 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4592  malate synthase  52.32 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4503  malate synthase  52.83 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4394  malate synthase  51.83 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3958  malate synthase  51.58 
 
 		 532 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0450  malate synthase A  49.41 
 
 		 532 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3983  malate synthase A  48.6 
 
 		 533 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  50.12 
 
 		 533 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4016  malate synthase  48.6 
 
 		 533 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5484  malate synthase  50.37 
 
 		 533 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03886  malate synthase  48.6 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.836126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03846  hypothetical protein  48.6 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4248  malate synthase  50.12 
 
 		 533 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4556  malate synthase  50.12 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4468  malate synthase  50.12 
 
 		 533 aa  425  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.554471  normal  0.0868855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4508  malate synthase  48.36 
 
 		 533 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2439  malate synthase  52.58 
 
 		 534 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  50.26 
 
 		 526 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  45.48 
 
 		 1110 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  46.56 
 
 		 534 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  47.37 
 
 		 541 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  44.76 
 
 		 1111 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  44.52 
 
 		 1111 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  41.63 
 
 		 522 aa  353  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  42.99 
 
 		 547 aa  350  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  44.64 
 
 		 529 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  46.02 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  44.95 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  44.44 
 
 		 536 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  44.71 
 
 		 529 aa  346  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  44.47 
 
 		 529 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  44.47 
 
 		 529 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  44.47 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  44.26 
 
 		 532 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  44.47 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  44.47 
 
 		 529 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  43.91 
 
 		 540 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  44.52 
 
 		 1111 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  45.16 
 
 		 530 aa  342  9e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  44.99 
 
 		 529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  44.99 
 
 		 529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  44.16 
 
 		 523 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  43.42 
 
 		 523 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  42.52 
 
 		 538 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  43.84 
 
 		 532 aa  332  8e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3433  malate synthase  45.22 
 
 		 532 aa  332  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.680692  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  41.19 
 
 		 532 aa  330  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28350  malate synthase A  42.82 
 
 		 534 aa  329  7e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0888845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  43.61 
 
 		 530 aa  329  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2261  Malate synthase  44.78 
 
 		 528 aa  329  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0633899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  43.86 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  43.61 
 
 		 530 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  43.61 
 
 		 530 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02910  malate synthase, putative  43.41 
 
 		 538 aa  326  5e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  43.42 
 
 		 535 aa  325  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  43.1 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  43.1 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  43.36 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  43.1 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  43.1 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  43.1 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  43.1 
 
 		 530 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  43.36 
 
 		 530 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  43.36 
 
 		 530 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  42.86 
 
 		 530 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  42.11 
 
 		 521 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  42.11 
 
 		 524 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  43.11 
 
 		 530 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1228  malate synthase  44.42 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112102  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3212  malate synthase  43.29 
 
 		 532 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  44.47 
 
 		 543 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09650  malate synthase  44.14 
 
 		 521 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.143579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  41.22 
 
 		 536 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0188  malate synthase  44.82 
 
 		 545 aa  319  7.999999999999999e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162826  normal  0.721995 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>