242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3983 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03886  malate synthase  99.81 
 
 		 533 aa  1110    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.836126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01041  malate synthase  70.82 
 
 		 544 aa  757    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3983  malate synthase A  100 
 
 		 533 aa  1112    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1483  malate synthase  67.98 
 
 		 549 aa  751    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4468  malate synthase  99.44 
 
 		 533 aa  1107    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.554471  normal  0.0868855 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3779  malate synthase  82.8 
 
 		 532 aa  917    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1414  malate synthase  67.49 
 
 		 572 aa  754    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0160844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1307  malate synthase  70.04 
 
 		 549 aa  754    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3958  malate synthase  81.47 
 
 		 532 aa  907    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4394  malate synthase  90.81 
 
 		 534 aa  1023    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4516  malate synthase  90.99 
 
 		 534 aa  1025    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.070236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1238  malate synthase  70.04 
 
 		 575 aa  753    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27419  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3043  malate synthase  70.04 
 
 		 549 aa  754    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0266  malate synthase  71.05 
 
 		 556 aa  791    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00405334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0365  malate synthase A  80.83 
 
 		 532 aa  894    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1343  malate synthase  69.84 
 
 		 549 aa  752    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1245  malate synthase  69.03 
 
 		 555 aa  766    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000965788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4016  malate synthase  100 
 
 		 533 aa  1112    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0450  malate synthase A  78.01 
 
 		 532 aa  875    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  89.68 
 
 		 533 aa  1007    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4592  malate synthase  90.99 
 
 		 534 aa  1025    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4248  malate synthase  98.87 
 
 		 533 aa  1102    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2767  malate synthase  67.98 
 
 		 549 aa  753    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2845  malate synthase  68.36 
 
 		 549 aa  758    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0745518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4503  malate synthase  83.11 
 
 		 532 aa  924    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1101  malate synthase  69.14 
 
 		 550 aa  761    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4556  malate synthase  99.06 
 
 		 533 aa  1103    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5484  malate synthase  99.62 
 
 		 533 aa  1107    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2943  malate synthase  68.36 
 
 		 549 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0164424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2381  malate synthase  67.98 
 
 		 543 aa  757    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4429  malate synthase  90.99 
 
 		 534 aa  1025    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2439  malate synthase  72.85 
 
 		 534 aa  791    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  79.55 
 
 		 532 aa  893    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1290  malate synthase  66.3 
 
 		 554 aa  738    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0294  malate synthase  79.74 
 
 		 532 aa  895    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0364  malate synthase  79.74 
 
 		 532 aa  895    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03846  hypothetical protein  99.81 
 
 		 533 aa  1110    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1316  malate synthase  69.84 
 
 		 549 aa  751    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.304553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  71.01 
 
 		 542 aa  777    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4508  malate synthase  99.44 
 
 		 533 aa  1103    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1275  malate synthase  67.72 
 
 		 544 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.412232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4519  malate synthase  90.99 
 
 		 534 aa  1025    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.492257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  56.3 
 
 		 534 aa  599  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  56.24 
 
 		 541 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  55.7 
 
 		 526 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  55.02 
 
 		 1111 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  54.25 
 
 		 1111 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  52.62 
 
 		 522 aa  570  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  55.27 
 
 		 529 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  55.08 
 
 		 529 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  55.27 
 
 		 529 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  55.27 
 
 		 529 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  55.27 
 
 		 529 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  55.27 
 
 		 529 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  54.63 
 
 		 1111 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  54.49 
 
 		 529 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  54.98 
 
 		 532 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  54.69 
 
 		 529 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  53.41 
 
 		 1110 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  55.27 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  54.49 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  54.88 
 
 		 529 aa  555  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  52.59 
 
 		 530 aa  542  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  49.63 
 
 		 536 aa  544  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  50.39 
 
 		 540 aa  529  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  49.52 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  50.93 
 
 		 530 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  50.93 
 
 		 530 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  50.38 
 
 		 538 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  50.93 
 
 		 530 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  50.93 
 
 		 530 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  50.93 
 
 		 530 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  50.56 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  50.93 
 
 		 530 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  50.37 
 
 		 530 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  48.85 
 
 		 523 aa  521  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  51.74 
 
 		 547 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4798  malate synthase A  49.43 
 
 		 536 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  49.72 
 
 		 534 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  48.47 
 
 		 523 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  49.63 
 
 		 530 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  49.44 
 
 		 530 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  49.81 
 
 		 543 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  50.39 
 
 		 528 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0188  malate synthase  52.91 
 
 		 545 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162826  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  49.43 
 
 		 532 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0248  malate synthase A  49.81 
 
 		 540 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  48.88 
 
 		 530 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  48.88 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3433  malate synthase  49.9 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.680692  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06653  Malate synthase, glyoxysomal (EC 2.3.3.9) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P28344]  49.62 
 
 		 539 aa  503  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  49.52 
 
 		 521 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  50.49 
 
 		 530 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  50.29 
 
 		 536 aa  505  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0159  malate synthase  51.18 
 
 		 528 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3212  malate synthase  48.96 
 
 		 532 aa  500  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  50.29 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  49.51 
 
 		 536 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  50.29 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1364  malate synthase  49.42 
 
 		 540 aa  498  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>