193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6025 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1363  malate synthase  79.09 
 
 
529 aa  871    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  60.73 
 
 
529 aa  662    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  61.03 
 
 
530 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  59.96 
 
 
529 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  59.96 
 
 
529 aa  658    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  60.54 
 
 
529 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  91.32 
 
 
530 aa  1019    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  87.36 
 
 
530 aa  966    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  97.17 
 
 
530 aa  1070    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3101  malate synthase  73.22 
 
 
532 aa  815    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  61.44 
 
 
532 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1951  malate synthase  80.04 
 
 
528 aa  882    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  91.32 
 
 
530 aa  1019    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  97.55 
 
 
530 aa  1072    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  60.73 
 
 
529 aa  660    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  59.96 
 
 
529 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  91.32 
 
 
530 aa  1016    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  88.78 
 
 
536 aa  971    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  60.34 
 
 
529 aa  659    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  61.69 
 
 
529 aa  671    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1390  malate synthase  79.47 
 
 
527 aa  875    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153679  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  60.71 
 
 
522 aa  658    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  96.23 
 
 
530 aa  1064    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  100 
 
 
530 aa  1096    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1236  malate synthase  79.28 
 
 
526 aa  874    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237852  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  97.74 
 
 
530 aa  1077    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  100 
 
 
530 aa  1096    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  60.15 
 
 
529 aa  659    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  99.81 
 
 
530 aa  1093    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  91.32 
 
 
530 aa  1019    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0159  malate synthase  76.89 
 
 
528 aa  852    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  91.32 
 
 
530 aa  1019    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  64.92 
 
 
532 aa  712    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  91.13 
 
 
530 aa  1016    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  91.32 
 
 
530 aa  1019    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  60.34 
 
 
529 aa  658    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1302  malate synthase  78.71 
 
 
526 aa  869    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  61.5 
 
 
534 aa  676    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  87.88 
 
 
536 aa  968    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  60.34 
 
 
529 aa  661    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  59.66 
 
 
524 aa  639    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  57.38 
 
 
536 aa  626  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  59.77 
 
 
521 aa  622  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  58.59 
 
 
528 aa  623  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  57.38 
 
 
543 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  58.38 
 
 
534 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  57.04 
 
 
1110 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  57.52 
 
 
541 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  55.68 
 
 
526 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  58.21 
 
 
535 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2261  Malate synthase  57.55 
 
 
528 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0633899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1139  malate synthase A  57.36 
 
 
528 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  56.31 
 
 
1111 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  56.31 
 
 
1111 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  53.8 
 
 
538 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  55.34 
 
 
523 aa  587  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06653  Malate synthase, glyoxysomal (EC 2.3.3.9) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P28344]  56.49 
 
 
539 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213946  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09650  malate synthase  57.62 
 
 
521 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.143579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  56.12 
 
 
1111 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0248  malate synthase A  57.5 
 
 
540 aa  579  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  55.15 
 
 
523 aa  578  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5004  malate synthase A  56.09 
 
 
519 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522377  normal  0.192489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5340  malate synthase A  56.08 
 
 
537 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.641734 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02910  malate synthase, putative  53.08 
 
 
538 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0710  malate synthase  56 
 
 
550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3433  malate synthase  54.74 
 
 
532 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.680692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0582  malate synthase  55.34 
 
 
554 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  51.13 
 
 
532 aa  555  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4798  malate synthase A  54.92 
 
 
536 aa  558  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1228  malate synthase  55.05 
 
 
541 aa  552  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112102  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28350  malate synthase A  55.47 
 
 
534 aa  548  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0888845  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53620  Malate synthase, glyoxysomal (MASY)  51.47 
 
 
551 aa  548  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  51.53 
 
 
540 aa  548  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3212  malate synthase  53.77 
 
 
532 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  52.26 
 
 
547 aa  544  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0998  malate synthase A  55.88 
 
 
562 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54478  malate synthase  52.88 
 
 
553 aa  529  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0693019  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  50.38 
 
 
542 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02090  malate synthase A  52.1 
 
 
587 aa  522  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2767  malate synthase  51.05 
 
 
549 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223378  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2845  malate synthase  50.86 
 
 
549 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0745518  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  51.47 
 
 
533 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1483  malate synthase  50.67 
 
 
549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2943  malate synthase  50.67 
 
 
549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0164424  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2381  malate synthase  51.21 
 
 
543 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1316  malate synthase  50.86 
 
 
549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.304553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01041  malate synthase  50.19 
 
 
544 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1343  malate synthase  50.48 
 
 
549 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  51.47 
 
 
532 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4503  malate synthase  51.05 
 
 
532 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1245  malate synthase  50.57 
 
 
555 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000965788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0364  malate synthase  51.47 
 
 
532 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3043  malate synthase  50.67 
 
 
549 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653137  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1238  malate synthase  50.67 
 
 
575 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1307  malate synthase  50.67 
 
 
549 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0294  malate synthase  51.47 
 
 
532 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4516  malate synthase  51.08 
 
 
534 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.070236 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4592  malate synthase  51.08 
 
 
534 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5942  malate synthase A  52.09 
 
 
513 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2227  malate synthase  52.29 
 
 
526 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>