159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1363 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1363  malate synthase  100 
 
 		 529 aa  1095    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  79.96 
 
 		 530 aa  888    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3101  malate synthase  71.8 
 
 		 532 aa  796    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  60.87 
 
 		 532 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1951  malate synthase  87.12 
 
 		 528 aa  967    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  79.96 
 
 		 530 aa  888    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  79.28 
 
 		 530 aa  875    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  79.77 
 
 		 530 aa  887    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  78.33 
 
 		 536 aa  868    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1390  malate synthase  86.15 
 
 		 527 aa  957    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153679  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  79.09 
 
 		 530 aa  871    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  78.9 
 
 		 530 aa  875    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  79.09 
 
 		 530 aa  871    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  79.96 
 
 		 530 aa  888    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0159  malate synthase  81.51 
 
 		 528 aa  907    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  79.96 
 
 		 530 aa  888    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  65.65 
 
 		 532 aa  717    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  80.15 
 
 		 530 aa  889    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  79.96 
 
 		 530 aa  888    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  59.39 
 
 		 529 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  61.41 
 
 		 530 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  80.04 
 
 		 530 aa  884    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1302  malate synthase  88.97 
 
 		 526 aa  991    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  79.28 
 
 		 530 aa  874    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  79.09 
 
 		 530 aa  878    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  78.71 
 
 		 530 aa  867    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  60.8 
 
 		 534 aa  643    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  78.52 
 
 		 536 aa  872    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1236  malate synthase  89.35 
 
 		 526 aa  991    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  59.92 
 
 		 522 aa  634  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  58.54 
 
 		 529 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  58.4 
 
 		 529 aa  626  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  59.04 
 
 		 529 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  58.65 
 
 		 529 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  58.65 
 
 		 529 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  59.13 
 
 		 524 aa  622  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  58.08 
 
 		 529 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  58.27 
 
 		 529 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  58.85 
 
 		 529 aa  617  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  58.08 
 
 		 529 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  58.08 
 
 		 529 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  56.83 
 
 		 543 aa  611  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  57.94 
 
 		 535 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  58.62 
 
 		 528 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  57.74 
 
 		 534 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2261  Malate synthase  57.22 
 
 		 528 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0633899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1139  malate synthase A  56.93 
 
 		 528 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  55.66 
 
 		 536 aa  598  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  57.33 
 
 		 521 aa  593  1e-168  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  56.9 
 
 		 541 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  55.18 
 
 		 1110 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  55.13 
 
 		 526 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06653  Malate synthase, glyoxysomal (EC 2.3.3.9) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P28344]  55.99 
 
 		 539 aa  565  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  54.17 
 
 		 1111 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09650  malate synthase  54.99 
 
 		 521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.143579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4798  malate synthase A  55.95 
 
 		 536 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  54.17 
 
 		 1111 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  54.73 
 
 		 1111 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  52.35 
 
 		 538 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  55.15 
 
 		 523 aa  559  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  54.49 
 
 		 523 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5004  malate synthase A  55.04 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522377  normal  0.192489 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53620  Malate synthase, glyoxysomal (MASY)  51.98 
 
 		 551 aa  546  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0248  malate synthase A  55.32 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5340  malate synthase A  55.23 
 
 		 537 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.641734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3212  malate synthase  53.01 
 
 		 532 aa  545  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28350  malate synthase A  55.01 
 
 		 534 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0888845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0710  malate synthase  54.01 
 
 		 550 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3433  malate synthase  52.8 
 
 		 532 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.680692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0998  malate synthase A  54.11 
 
 		 562 aa  539  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02910  malate synthase, putative  52.5 
 
 		 538 aa  536  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0582  malate synthase  53.44 
 
 		 554 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  49.91 
 
 		 532 aa  531  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1228  malate synthase  55.06 
 
 		 541 aa  525  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112102  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  50 
 
 		 540 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2227  malate synthase  52.84 
 
 		 526 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  50.37 
 
 		 547 aa  509  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02090  malate synthase A  53.67 
 
 		 587 aa  506  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2381  malate synthase  48.98 
 
 		 543 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4503  malate synthase  51.03 
 
 		 532 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1483  malate synthase  50.96 
 
 		 549 aa  502  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2767  malate synthase  51.15 
 
 		 549 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  50.88 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  49.34 
 
 		 542 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2845  malate synthase  50.96 
 
 		 549 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0745518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2943  malate synthase  50.96 
 
 		 549 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0164424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3043  malate synthase  49.91 
 
 		 549 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1316  malate synthase  50.09 
 
 		 549 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.304553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1238  malate synthase  50.47 
 
 		 575 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2005  malate synthase A  51.82 
 
 		 521 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0415447  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3779  malate synthase  49.53 
 
 		 532 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0922  malate synthase A  49.91 
 
 		 549 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1245  malate synthase  48.87 
 
 		 555 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000965788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1307  malate synthase  50.38 
 
 		 549 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3958  malate synthase  49.06 
 
 		 532 aa  497  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1343  malate synthase  49.72 
 
 		 549 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  50.29 
 
 		 532 aa  495  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0074  malate synthase A  50.28 
 
 		 555 aa  495  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03886  malate synthase  49.9 
 
 		 533 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.836126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03846  hypothetical protein  49.9 
 
 		 533 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>