232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0922 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0922  malate synthase A  100 
 
 
549 aa  1099    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5340  malate synthase A  61.67 
 
 
537 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.641734 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0074  malate synthase A  62.1 
 
 
555 aa  628  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  61.07 
 
 
532 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0710  malate synthase  59.2 
 
 
550 aa  608  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4798  malate synthase A  59.89 
 
 
536 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0582  malate synthase  58.29 
 
 
554 aa  593  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  59.01 
 
 
535 aa  591  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2261  Malate synthase  60.61 
 
 
528 aa  591  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0633899 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02090  malate synthase A  61.57 
 
 
587 aa  591  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  58.37 
 
 
534 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0998  malate synthase A  59.02 
 
 
562 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1139  malate synthase A  58.86 
 
 
528 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09650  malate synthase  59.01 
 
 
521 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.143579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5004  malate synthase A  60.27 
 
 
519 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522377  normal  0.192489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28350  malate synthase A  60.68 
 
 
534 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0888845  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0248  malate synthase A  60.15 
 
 
540 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3212  malate synthase  58.54 
 
 
532 aa  566  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1228  malate synthase  59.96 
 
 
541 aa  560  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112102  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2227  malate synthase  59.62 
 
 
526 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3433  malate synthase  57.27 
 
 
532 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.680692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  58.37 
 
 
528 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  57.01 
 
 
521 aa  550  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  56.11 
 
 
524 aa  549  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08200  malate synthase  57.14 
 
 
543 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  51.27 
 
 
529 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  52.08 
 
 
529 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  51.27 
 
 
529 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  52.08 
 
 
529 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  51.09 
 
 
529 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  51.51 
 
 
529 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  51.57 
 
 
529 aa  528  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  51.69 
 
 
529 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  51.51 
 
 
529 aa  524  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  51.19 
 
 
529 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  51.32 
 
 
529 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  54.32 
 
 
532 aa  519  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5942  malate synthase A  58.87 
 
 
513 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2005  malate synthase A  57.74 
 
 
521 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0415447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  53.39 
 
 
523 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  53.08 
 
 
534 aa  514  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  53.13 
 
 
523 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  51.34 
 
 
530 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  51.34 
 
 
530 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  51.34 
 
 
530 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  51.34 
 
 
530 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  51.15 
 
 
530 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  51.34 
 
 
530 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  50.76 
 
 
530 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  51.14 
 
 
530 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  53.21 
 
 
536 aa  505  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1236  malate synthase  50.19 
 
 
526 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237852  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1363  malate synthase  49.91 
 
 
529 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1302  malate synthase  49.81 
 
 
526 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  50.57 
 
 
530 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  50.67 
 
 
530 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0159  malate synthase  50.86 
 
 
528 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  49.81 
 
 
536 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  50 
 
 
530 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  49.71 
 
 
536 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  50.48 
 
 
530 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  52.42 
 
 
543 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  50.48 
 
 
530 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  50.57 
 
 
530 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1951  malate synthase  50.09 
 
 
528 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1390  malate synthase  50.19 
 
 
527 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153679  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  50.95 
 
 
526 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  52.48 
 
 
522 aa  486  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  50.56 
 
 
530 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  49.9 
 
 
530 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06653  Malate synthase, glyoxysomal (EC 2.3.3.9) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P28344]  49.33 
 
 
539 aa  477  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213946  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3101  malate synthase  49.33 
 
 
532 aa  475  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  52.29 
 
 
1111 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  46.77 
 
 
532 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  51.91 
 
 
1111 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  52.67 
 
 
1111 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  50.29 
 
 
541 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  49 
 
 
1110 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90814  Malate synthase 1, glyoxysomal (MAS) (DAL7)  45.49 
 
 
565 aa  470  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0778949  normal  0.869225 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02910  malate synthase, putative  52.64 
 
 
538 aa  463  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53620  Malate synthase, glyoxysomal (MASY)  47.51 
 
 
551 aa  465  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  47.82 
 
 
538 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5698  malate synthase A  51.38 
 
 
525 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1364  malate synthase  48.64 
 
 
540 aa  455  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  48.94 
 
 
540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  45.01 
 
 
542 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  44.57 
 
 
532 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3958  malate synthase  45.16 
 
 
532 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0294  malate synthase  44.57 
 
 
532 aa  445  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0364  malate synthase  44.57 
 
 
532 aa  445  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  48.22 
 
 
547 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3779  malate synthase  45.13 
 
 
532 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3983  malate synthase A  44.7 
 
 
533 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4519  malate synthase  45.01 
 
 
534 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.492257  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4248  malate synthase  44.7 
 
 
533 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4016  malate synthase  44.7 
 
 
533 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4592  malate synthase  45.01 
 
 
534 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4429  malate synthase  45.01 
 
 
534 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4516  malate synthase  45.01 
 
 
534 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.070236 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4394  malate synthase  45.01 
 
 
534 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>