196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08200 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0248  malate synthase A  64.82 
 
 		 540 aa  638    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3433  malate synthase  68.42 
 
 		 532 aa  744    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.680692  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08200  malate synthase  100 
 
 		 543 aa  1098    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3212  malate synthase  67.29 
 
 		 532 aa  726    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  59.78 
 
 		 532 aa  628  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09650  malate synthase  63.65 
 
 		 521 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.143579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  60.59 
 
 		 535 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2261  Malate synthase  61.09 
 
 		 528 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0633899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  61.04 
 
 		 534 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1139  malate synthase A  60.85 
 
 		 528 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5942  malate synthase A  62.55 
 
 		 513 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4798  malate synthase A  57.22 
 
 		 536 aa  600  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5004  malate synthase A  59.85 
 
 		 519 aa  584  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522377  normal  0.192489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5340  malate synthase A  57.69 
 
 		 537 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.641734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  58.73 
 
 		 528 aa  559  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0710  malate synthase  56.54 
 
 		 550 aa  555  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0582  malate synthase  56.54 
 
 		 554 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0074  malate synthase A  54.96 
 
 		 555 aa  554  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  56.64 
 
 		 521 aa  550  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28350  malate synthase A  59.19 
 
 		 534 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0888845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  56.16 
 
 		 524 aa  545  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0998  malate synthase A  54.26 
 
 		 562 aa  541  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0922  malate synthase A  57.14 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02090  malate synthase A  56.43 
 
 		 587 aa  536  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1228  malate synthase  56.84 
 
 		 541 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112102  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  53.35 
 
 		 532 aa  534  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  51.85 
 
 		 534 aa  528  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  52.66 
 
 		 529 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  52.85 
 
 		 529 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  52.66 
 
 		 529 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  52.66 
 
 		 529 aa  524  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  52.47 
 
 		 529 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  52.66 
 
 		 529 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  52.85 
 
 		 529 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  52.21 
 
 		 529 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  52.47 
 
 		 529 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  52.19 
 
 		 529 aa  525  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  52.85 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2227  malate synthase  55.56 
 
 		 526 aa  508  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1302  malate synthase  50.47 
 
 		 526 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  49.34 
 
 		 530 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  50.47 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  49.34 
 
 		 530 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  50.09 
 
 		 530 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  49.53 
 
 		 530 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  50.09 
 
 		 536 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  51.59 
 
 		 526 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  49.34 
 
 		 530 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  49.34 
 
 		 530 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  49.34 
 
 		 530 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  49.91 
 
 		 530 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  50.28 
 
 		 530 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1236  malate synthase  49.91 
 
 		 526 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  49.72 
 
 		 530 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  50.09 
 
 		 536 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  49.34 
 
 		 530 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1951  malate synthase  49.91 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1390  malate synthase  49.91 
 
 		 527 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153679  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  50.09 
 
 		 530 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  50.64 
 
 		 547 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  50.09 
 
 		 530 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  52.66 
 
 		 543 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1363  malate synthase  49.35 
 
 		 529 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  51.12 
 
 		 536 aa  491  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  50.57 
 
 		 1110 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  50.19 
 
 		 530 aa  487  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  52.4 
 
 		 1111 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  52.35 
 
 		 522 aa  484  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0159  malate synthase  48.62 
 
 		 528 aa  485  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  51.15 
 
 		 1111 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  50.74 
 
 		 523 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  48.04 
 
 		 530 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2005  malate synthase A  56.03 
 
 		 521 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0415447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  51.15 
 
 		 1111 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  51.01 
 
 		 523 aa  481  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02910  malate synthase, putative  48.59 
 
 		 538 aa  474  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  48.33 
 
 		 541 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0450  malate synthase A  48.46 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0365  malate synthase A  47.82 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4429  malate synthase  46.28 
 
 		 534 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3101  malate synthase  48.17 
 
 		 532 aa  467  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  45.75 
 
 		 532 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4516  malate synthase  46.28 
 
 		 534 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.070236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4519  malate synthase  46.28 
 
 		 534 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.492257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4394  malate synthase  46.28 
 
 		 534 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4503  malate synthase  47 
 
 		 532 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4592  malate synthase  46.28 
 
 		 534 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3779  malate synthase  47.51 
 
 		 532 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03886  malate synthase  45.62 
 
 		 533 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.836126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3983  malate synthase A  45.81 
 
 		 533 aa  465  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0364  malate synthase  45.75 
 
 		 532 aa  465  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4016  malate synthase  45.81 
 
 		 533 aa  465  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  46.73 
 
 		 532 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03846  hypothetical protein  45.62 
 
 		 533 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  45.91 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  46.54 
 
 		 540 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3958  malate synthase  47.32 
 
 		 532 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0294  malate synthase  45.75 
 
 		 532 aa  465  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4508  malate synthase  45.62 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4248  malate synthase  45.81 
 
 		 533 aa  465  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>