220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2530 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  62.81 
 
 
1111 aa  664    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  60.9 
 
 
536 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1363  malate synthase  60.8 
 
 
529 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  66.92 
 
 
529 aa  730    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  61.31 
 
 
543 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  62.06 
 
 
530 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  66.35 
 
 
529 aa  726    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  66.35 
 
 
529 aa  725    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  67.11 
 
 
529 aa  723    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  61.12 
 
 
530 aa  678    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3101  malate synthase  58.9 
 
 
532 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1951  malate synthase  60.23 
 
 
528 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  62.31 
 
 
1110 aa  680    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  61.12 
 
 
530 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  61.12 
 
 
530 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  66.35 
 
 
529 aa  726    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  61.68 
 
 
530 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  63.95 
 
 
1111 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  62.78 
 
 
521 aa  654    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  100 
 
 
534 aa  1102    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  62.55 
 
 
530 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  61.55 
 
 
536 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  62.62 
 
 
1111 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  58.17 
 
 
532 aa  641    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  67.64 
 
 
526 aa  738    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  62.8 
 
 
522 aa  682    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  67.3 
 
 
529 aa  731    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  61.5 
 
 
530 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  65.3 
 
 
536 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  66.54 
 
 
529 aa  727    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  61.73 
 
 
524 aa  646    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  61.5 
 
 
530 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1236  malate synthase  59.21 
 
 
526 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237852  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  61.5 
 
 
530 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  66.92 
 
 
529 aa  728    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  70.21 
 
 
532 aa  753    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  61.29 
 
 
523 aa  662    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  61.12 
 
 
530 aa  678    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  59.81 
 
 
541 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1302  malate synthase  59.77 
 
 
526 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  61.5 
 
 
530 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  61.12 
 
 
530 aa  678    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  66.35 
 
 
529 aa  725    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  61.31 
 
 
530 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  61.12 
 
 
530 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  66.54 
 
 
529 aa  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  59.85 
 
 
538 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  66.73 
 
 
529 aa  746    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  60.93 
 
 
530 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  61.31 
 
 
530 aa  678    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  60.8 
 
 
523 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  64.96 
 
 
528 aa  670    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  59.81 
 
 
532 aa  633  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1390  malate synthase  58.71 
 
 
527 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153679  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  60.26 
 
 
535 aa  633  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0159  malate synthase  58.9 
 
 
528 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2261  Malate synthase  60.75 
 
 
528 aa  628  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0633899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  55.43 
 
 
540 aa  624  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0248  malate synthase A  61.84 
 
 
540 aa  624  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1139  malate synthase A  60 
 
 
528 aa  617  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3433  malate synthase  59.22 
 
 
532 aa  608  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.680692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  58.37 
 
 
533 aa  609  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  56.27 
 
 
542 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4516  malate synthase  57.98 
 
 
534 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.070236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4429  malate synthase  57.98 
 
 
534 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4394  malate synthase  57.78 
 
 
534 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4592  malate synthase  57.98 
 
 
534 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4519  malate synthase  57.98 
 
 
534 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.492257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  57.38 
 
 
534 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4248  malate synthase  56.92 
 
 
533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09650  malate synthase  61.97 
 
 
521 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.143579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2381  malate synthase  57.2 
 
 
543 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4503  malate synthase  57.78 
 
 
532 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577319 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06653  Malate synthase, glyoxysomal (EC 2.3.3.9) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P28344]  56.98 
 
 
539 aa  598  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213946  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03886  malate synthase  56.3 
 
 
533 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.836126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3983  malate synthase A  56.3 
 
 
533 aa  599  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5484  malate synthase  56.54 
 
 
533 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03846  hypothetical protein  56.3 
 
 
533 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4468  malate synthase  56.73 
 
 
533 aa  601  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.554471  normal  0.0868855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4556  malate synthase  56.73 
 
 
533 aa  601  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  56.23 
 
 
547 aa  600  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4016  malate synthase  56.3 
 
 
533 aa  599  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0364  malate synthase  56.81 
 
 
532 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3212  malate synthase  57.86 
 
 
532 aa  595  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4508  malate synthase  56.11 
 
 
533 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0294  malate synthase  56.81 
 
 
532 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  56.81 
 
 
532 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0266  malate synthase  55.92 
 
 
556 aa  595  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00405334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1483  malate synthase  56.36 
 
 
549 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3043  malate synthase  56.36 
 
 
549 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653137  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1307  malate synthase  56.36 
 
 
549 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1316  malate synthase  56.36 
 
 
549 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.304553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1238  malate synthase  56.26 
 
 
575 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0365  malate synthase A  58.09 
 
 
532 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1343  malate synthase  56.17 
 
 
549 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1245  malate synthase  56.7 
 
 
555 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000965788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2767  malate synthase  56.57 
 
 
549 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223378  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2845  malate synthase  56.55 
 
 
549 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0745518  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2943  malate synthase  56.55 
 
 
549 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0164424  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01041  malate synthase  55.89 
 
 
544 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>