179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4376 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  60.98 
 
 		 524 aa  648    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  62.33 
 
 		 521 aa  650    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  91.59 
 
 		 523 aa  998    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  65.39 
 
 		 528 aa  674    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  100 
 
 		 523 aa  1069    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  61.29 
 
 		 534 aa  662    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  59.43 
 
 		 532 aa  624  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  60.15 
 
 		 532 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  58.73 
 
 		 522 aa  613  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  56.37 
 
 		 535 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  56.71 
 
 		 536 aa  600  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  54.77 
 
 		 529 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  56.06 
 
 		 530 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  57 
 
 		 526 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  56.25 
 
 		 530 aa  595  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  55.87 
 
 		 530 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  55.87 
 
 		 530 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  55.81 
 
 		 530 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  55.87 
 
 		 530 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  55.87 
 
 		 530 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  55.87 
 
 		 530 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  55.87 
 
 		 530 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  55.24 
 
 		 529 aa  588  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  55.24 
 
 		 529 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  55.24 
 
 		 529 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  55.24 
 
 		 529 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  55.05 
 
 		 530 aa  591  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  55.24 
 
 		 529 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  55.11 
 
 		 536 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  55.43 
 
 		 530 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  55.24 
 
 		 530 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  55.24 
 
 		 529 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  54.89 
 
 		 538 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  55.24 
 
 		 529 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  55.34 
 
 		 530 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  55.05 
 
 		 530 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  55.34 
 
 		 530 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  55.43 
 
 		 529 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  55.43 
 
 		 529 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  54.17 
 
 		 536 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  56.75 
 
 		 543 aa  588  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  56.47 
 
 		 534 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  54.86 
 
 		 529 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3101  malate synthase  54.53 
 
 		 532 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2261  Malate synthase  57.22 
 
 		 528 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0633899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1302  malate synthase  54.68 
 
 		 526 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1139  malate synthase A  56.84 
 
 		 528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1236  malate synthase  54.39 
 
 		 526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  53.79 
 
 		 530 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5004  malate synthase A  57.86 
 
 		 519 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522377  normal  0.192489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1390  malate synthase  53.44 
 
 		 527 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153679  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1363  malate synthase  54.49 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1951  malate synthase  53.14 
 
 		 528 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937634  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0159  malate synthase  53.32 
 
 		 528 aa  558  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0248  malate synthase A  57.59 
 
 		 540 aa  558  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  52.46 
 
 		 547 aa  555  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  53.93 
 
 		 541 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1228  malate synthase  56.68 
 
 		 541 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112102  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0998  malate synthase A  53.69 
 
 		 562 aa  549  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0074  malate synthase A  55.47 
 
 		 555 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  51.61 
 
 		 1110 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  50.2 
 
 		 532 aa  545  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06653  Malate synthase, glyoxysomal (EC 2.3.3.9) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P28344]  52.92 
 
 		 539 aa  541  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28350  malate synthase A  55.45 
 
 		 534 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0888845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3433  malate synthase  54.47 
 
 		 532 aa  541  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.680692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  52.46 
 
 		 1111 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  52.46 
 
 		 1111 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  52.76 
 
 		 1111 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  49.62 
 
 		 540 aa  535  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2227  malate synthase  53.65 
 
 		 526 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  50.58 
 
 		 533 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5340  malate synthase A  53.32 
 
 		 537 aa  534  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.641734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4798  malate synthase A  52.17 
 
 		 536 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3212  malate synthase  53.7 
 
 		 532 aa  531  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0710  malate synthase  55.66 
 
 		 550 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0582  malate synthase  55.25 
 
 		 554 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02910  malate synthase, putative  51.44 
 
 		 538 aa  525  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09650  malate synthase  53.71 
 
 		 521 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.143579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0450  malate synthase A  51.07 
 
 		 532 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03886  malate synthase  48.85 
 
 		 533 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.836126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3983  malate synthase A  48.85 
 
 		 533 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4592  malate synthase  48.76 
 
 		 534 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4394  malate synthase  48.95 
 
 		 534 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2767  malate synthase  49.15 
 
 		 549 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2845  malate synthase  49.34 
 
 		 549 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0745518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4519  malate synthase  48.76 
 
 		 534 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.492257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03846  hypothetical protein  48.85 
 
 		 533 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4016  malate synthase  48.85 
 
 		 533 aa  521  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4429  malate synthase  48.76 
 
 		 534 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53620  Malate synthase, glyoxysomal (MASY)  51.14 
 
 		 551 aa  521  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4468  malate synthase  49.12 
 
 		 533 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.554471  normal  0.0868855 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4516  malate synthase  48.76 
 
 		 534 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.070236 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  49.43 
 
 		 542 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4248  malate synthase  49.32 
 
 		 533 aa  521  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4556  malate synthase  49.12 
 
 		 533 aa  519  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0922  malate synthase A  53.39 
 
 		 549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4508  malate synthase  48.47 
 
 		 533 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1245  malate synthase  48.39 
 
 		 555 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000965788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2943  malate synthase  49.15 
 
 		 549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0164424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2381  malate synthase  48.88 
 
 		 543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>