More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2963 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  58.73 
 
 
529 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  58.54 
 
 
529 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  58.54 
 
 
529 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  58.93 
 
 
529 aa  641    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  100 
 
 
1110 aa  2271    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  60.27 
 
 
529 aa  661    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4054  isocitrate lyase  72.36 
 
 
492 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  57.87 
 
 
529 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  58.54 
 
 
529 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  78.24 
 
 
1111 aa  1713    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  77.88 
 
 
1111 aa  1738    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  62.31 
 
 
534 aa  680    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  77.07 
 
 
430 aa  667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  73.85 
 
 
428 aa  641    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  75.3 
 
 
428 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  73.14 
 
 
443 aa  640    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  57.63 
 
 
536 aa  638    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  58.54 
 
 
529 aa  646    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0040  isocitrate lyase  75.43 
 
 
426 aa  637    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4375  isocitrate lyase  75.61 
 
 
428 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  59.63 
 
 
543 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  77.7 
 
 
1111 aa  1735    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  61.67 
 
 
532 aa  664    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  58.54 
 
 
529 aa  641    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  59.12 
 
 
529 aa  646    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  58.73 
 
 
529 aa  643    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  72.3 
 
 
425 aa  636    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  72.55 
 
 
425 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4164  isocitrate lyase  73.9 
 
 
428 aa  632  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.652432  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  72.55 
 
 
425 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1033  isocitrate lyase  72.06 
 
 
425 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00237406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  58.28 
 
 
526 aa  627  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4157  isocitrate lyase  72.06 
 
 
425 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0289432  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  72.3 
 
 
425 aa  629  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  72.3 
 
 
425 aa  629  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  72.3 
 
 
425 aa  629  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  72.3 
 
 
425 aa  629  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2063  isocitrate lyase  74.02 
 
 
426 aa  628  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  72.3 
 
 
425 aa  629  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1182  isocitrate lyase  72.06 
 
 
425 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00317473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  73.97 
 
 
430 aa  624  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0311  isocitrate lyase  71.02 
 
 
429 aa  625  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.251887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  72.24 
 
 
431 aa  622  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0405  isocitrate lyase  70.55 
 
 
429 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0308  isocitrate lyase  69.36 
 
 
429 aa  619  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1009  isocitrate lyase  71.95 
 
 
429 aa  616  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1558  isocitrate lyase  70.31 
 
 
429 aa  619  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  57.04 
 
 
530 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_004310  BR1614  isocitrate lyase  69.83 
 
 
429 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.642543  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  57.04 
 
 
530 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3930  isocitrate lyase  69.95 
 
 
429 aa  614  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  57.04 
 
 
530 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  72.62 
 
 
429 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  56.47 
 
 
530 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  57.12 
 
 
530 aa  611  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0373  isocitrate lyase  69.83 
 
 
429 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432855  hitchhiker  0.00124435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  57.04 
 
 
530 aa  612  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  56.66 
 
 
530 aa  611  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  57.04 
 
 
530 aa  612  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  72.73 
 
 
428 aa  609  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  71.53 
 
 
461 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  55.87 
 
 
541 aa  608  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  57.14 
 
 
522 aa  603  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0816  isocitrate lyase  68.03 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.745785  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  54.65 
 
 
538 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1961  isocitrate lyase  70.52 
 
 
431 aa  602  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  71.95 
 
 
429 aa  601  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  71.43 
 
 
427 aa  602  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1097  isocitrate lyase  68.62 
 
 
435 aa  602  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  54.85 
 
 
536 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  55.85 
 
 
530 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  55.85 
 
 
530 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0189  isocitrate lyase  71.01 
 
 
433 aa  597  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0259015  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  55.85 
 
 
530 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  55.85 
 
 
530 aa  598  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  55.04 
 
 
536 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  70.02 
 
 
431 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  56.04 
 
 
530 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2006  isocitrate lyase  72.55 
 
 
422 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  70.6 
 
 
435 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  55.85 
 
 
530 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  55.85 
 
 
530 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  55.64 
 
 
530 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  70.12 
 
 
435 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  70.6 
 
 
435 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2985  isocitrate lyase  69.19 
 
 
435 aa  594  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.54257  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  70.12 
 
 
435 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0266  malate synthase  53.82 
 
 
556 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00405334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  57.36 
 
 
528 aa  595  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  70.12 
 
 
475 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  53.9 
 
 
542 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  70.12 
 
 
435 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  70.39 
 
 
434 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28360  isocitrate lyase  71.01 
 
 
432 aa  592  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.721222  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  70.6 
 
 
435 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  70.12 
 
 
435 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0592  isocitrate lyase  67.95 
 
 
432 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442111  normal  0.573655 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  70.12 
 
 
435 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  70.12 
 
 
475 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1402  isocitrate lyase  70.76 
 
 
422 aa  590  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>