172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0593 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  60 
 
 		 529 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  59.43 
 
 		 529 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  59.25 
 
 		 529 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  59.81 
 
 		 529 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  59.43 
 
 		 529 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  59.81 
 
 		 534 aa  650    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  61.13 
 
 		 526 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  60.19 
 
 		 529 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  59.43 
 
 		 529 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  58.68 
 
 		 529 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  100 
 
 		 541 aa  1123    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  60.57 
 
 		 529 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  60.84 
 
 		 532 aa  634  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  58.68 
 
 		 529 aa  631  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  58.68 
 
 		 529 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  59.35 
 
 		 1111 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  56.24 
 
 		 538 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  58.95 
 
 		 530 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  58.97 
 
 		 1111 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  58.46 
 
 		 530 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  58.19 
 
 		 530 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  58.19 
 
 		 530 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  59.73 
 
 		 1111 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  58.27 
 
 		 530 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  58.19 
 
 		 530 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  58.19 
 
 		 530 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  58.19 
 
 		 530 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  58.19 
 
 		 530 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  58.08 
 
 		 530 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  57.89 
 
 		 530 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  57.52 
 
 		 530 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  57.52 
 
 		 530 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  57.71 
 
 		 530 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  58.05 
 
 		 535 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  55.87 
 
 		 1110 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1302  malate synthase  58.05 
 
 		 526 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  56.05 
 
 		 536 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1236  malate synthase  57.87 
 
 		 526 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1245  malate synthase  55.76 
 
 		 555 aa  600  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000965788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1390  malate synthase  56.87 
 
 		 527 aa  598  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153679  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  56.01 
 
 		 543 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  55.2 
 
 		 536 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  55.89 
 
 		 530 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3983  malate synthase A  56.24 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  56.98 
 
 		 522 aa  597  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4248  malate synthase  56.42 
 
 		 533 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4016  malate synthase  56.24 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4468  malate synthase  56.24 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.554471  normal  0.0868855 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03886  malate synthase  56.24 
 
 		 533 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.836126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1363  malate synthase  56.9 
 
 		 529 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1951  malate synthase  57.33 
 
 		 528 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03846  hypothetical protein  56.24 
 
 		 533 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  55.66 
 
 		 533 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4556  malate synthase  56.24 
 
 		 533 aa  594  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4503  malate synthase  58.28 
 
 		 532 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  56.77 
 
 		 536 aa  589  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  54.78 
 
 		 530 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1364  malate synthase  55.49 
 
 		 540 aa  588  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0294  malate synthase  57.31 
 
 		 532 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  57.31 
 
 		 532 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0364  malate synthase  57.31 
 
 		 532 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5484  malate synthase  56.05 
 
 		 533 aa  591  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  56.63 
 
 		 532 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4592  malate synthase  56.42 
 
 		 534 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4508  malate synthase  55.68 
 
 		 533 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4516  malate synthase  56.42 
 
 		 534 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.070236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4519  malate synthase  56.42 
 
 		 534 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.492257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0266  malate synthase  54.82 
 
 		 556 aa  585  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00405334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4429  malate synthase  56.42 
 
 		 534 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4394  malate synthase  56.23 
 
 		 534 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  54.81 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3101  malate synthase  55.2 
 
 		 532 aa  581  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2845  malate synthase  54.56 
 
 		 549 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0745518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2943  malate synthase  54.56 
 
 		 549 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0164424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  52.91 
 
 		 540 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1483  malate synthase  54.56 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2767  malate synthase  54.37 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  55.58 
 
 		 547 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0159  malate synthase  55.22 
 
 		 528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1316  malate synthase  54.63 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.304553  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3043  malate synthase  54.44 
 
 		 549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1307  malate synthase  53.8 
 
 		 549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1343  malate synthase  54.44 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3779  malate synthase  55.66 
 
 		 532 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2261  Malate synthase  55.93 
 
 		 528 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0633899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3958  malate synthase  55.66 
 
 		 532 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1275  malate synthase  54.43 
 
 		 544 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.412232 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1238  malate synthase  53.72 
 
 		 575 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0365  malate synthase A  56.04 
 
 		 532 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01041  malate synthase  54.42 
 
 		 544 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1101  malate synthase  53.15 
 
 		 550 aa  571  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  56.34 
 
 		 528 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0450  malate synthase A  54.72 
 
 		 532 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  56.06 
 
 		 534 aa  571  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2381  malate synthase  53.48 
 
 		 543 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  56.46 
 
 		 521 aa  566  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1414  malate synthase  52.83 
 
 		 572 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0160844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1139  malate synthase A  54.99 
 
 		 528 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  52.83 
 
 		 532 aa  561  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  54.8 
 
 		 524 aa  556  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>