212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0074 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5340  malate synthase A  60.49 
 
 
537 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.641734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0819  malate synthase  61.39 
 
 
532 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  60.67 
 
 
535 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0074  malate synthase A  100 
 
 
555 aa  1134    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5004  malate synthase A  61.88 
 
 
519 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522377  normal  0.192489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0710  malate synthase  59.3 
 
 
550 aa  637    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1139  malate synthase A  60.23 
 
 
528 aa  631  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0582  malate synthase  59.48 
 
 
554 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0922  malate synthase A  62.1 
 
 
549 aa  628  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0998  malate synthase A  58.29 
 
 
562 aa  627  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2261  Malate synthase  60.3 
 
 
528 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0633899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28350  malate synthase A  61.9 
 
 
534 aa  618  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0888845  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4798  malate synthase A  57.22 
 
 
536 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  57.97 
 
 
534 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  58.49 
 
 
528 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0248  malate synthase A  57.87 
 
 
540 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  56.52 
 
 
524 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09650  malate synthase  57.84 
 
 
521 aa  581  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.143579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1228  malate synthase  58.76 
 
 
541 aa  579  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112102  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2005  malate synthase A  59.81 
 
 
521 aa  581  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0415447  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3212  malate synthase  56.34 
 
 
532 aa  578  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  56.25 
 
 
521 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02090  malate synthase A  56.86 
 
 
587 aa  575  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2227  malate synthase  56.74 
 
 
526 aa  568  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3433  malate synthase  55.22 
 
 
532 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.680692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  52.62 
 
 
529 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  56.23 
 
 
523 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  54.17 
 
 
534 aa  560  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08200  malate synthase  54.96 
 
 
543 aa  554  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  52.06 
 
 
529 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  52.25 
 
 
529 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  51.69 
 
 
529 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  51.69 
 
 
529 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  51.69 
 
 
529 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  51.69 
 
 
529 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  55.47 
 
 
523 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5942  malate synthase A  58.33 
 
 
513 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  51.69 
 
 
529 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  51.69 
 
 
529 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06653  Malate synthase, glyoxysomal (EC 2.3.3.9) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P28344]  52.07 
 
 
539 aa  541  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213946  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  52.06 
 
 
529 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  51.69 
 
 
529 aa  544  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  53.38 
 
 
532 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  51.67 
 
 
526 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  52.84 
 
 
522 aa  534  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  54.23 
 
 
543 aa  525  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  51.4 
 
 
536 aa  522  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  50.55 
 
 
530 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02910  malate synthase, putative  53.21 
 
 
538 aa  518  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  50.55 
 
 
530 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  50.55 
 
 
530 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  50.55 
 
 
530 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  50.74 
 
 
530 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  50.55 
 
 
530 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  50.93 
 
 
530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  50.84 
 
 
530 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  50.65 
 
 
1110 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  50 
 
 
530 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  48.89 
 
 
532 aa  514  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1951  malate synthase  49.81 
 
 
528 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937634  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  49.72 
 
 
530 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  49.91 
 
 
530 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1390  malate synthase  50.75 
 
 
527 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153679  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1236  malate synthase  50.57 
 
 
526 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237852  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  50.09 
 
 
530 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  49.54 
 
 
530 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  50.09 
 
 
530 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  49.54 
 
 
530 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1302  malate synthase  50 
 
 
526 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0159  malate synthase  50.19 
 
 
528 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  47.5 
 
 
540 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  48.26 
 
 
536 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  50.75 
 
 
1111 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3101  malate synthase  48.97 
 
 
532 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  51.12 
 
 
1111 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  48.69 
 
 
536 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  50.56 
 
 
1111 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1363  malate synthase  50.28 
 
 
529 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  51.43 
 
 
547 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  47.85 
 
 
538 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  48.88 
 
 
541 aa  485  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  48.14 
 
 
530 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1364  malate synthase  49.25 
 
 
540 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90814  Malate synthase 1, glyoxysomal (MAS) (DAL7)  47.43 
 
 
565 aa  481  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0778949  normal  0.869225 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3779  malate synthase  47.43 
 
 
532 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5698  malate synthase A  51.63 
 
 
525 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  46.85 
 
 
542 aa  475  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3958  malate synthase  47.24 
 
 
532 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53620  Malate synthase, glyoxysomal (MASY)  45.9 
 
 
551 aa  474  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1245  malate synthase  45.79 
 
 
555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000965788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03886  malate synthase  45.97 
 
 
533 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.836126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3983  malate synthase A  46.15 
 
 
533 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4508  malate synthase  45.88 
 
 
533 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1483  malate synthase  44.16 
 
 
549 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0364  malate synthase  45.59 
 
 
532 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4016  malate synthase  46.15 
 
 
533 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  45.59 
 
 
532 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  45.11 
 
 
533 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1238  malate synthase  44.69 
 
 
575 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27419  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03846  hypothetical protein  45.97 
 
 
533 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>