More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4288 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 302 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  68.03 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  68.4 
 
 		 307 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  68.75 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  68.75 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  67.01 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  69.64 
 
 		 310 aa  352  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  70 
 
 		 310 aa  351  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  68.12 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  69.64 
 
 		 310 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  67.46 
 
 		 306 aa  348  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  67.35 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  62.08 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  67.69 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  65.76 
 
 		 306 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  57.24 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  64.09 
 
 		 315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  64.09 
 
 		 315 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  64.09 
 
 		 315 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  64.09 
 
 		 315 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  64.09 
 
 		 315 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  64.09 
 
 		 315 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  64.09 
 
 		 315 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  64.13 
 
 		 315 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  54.93 
 
 		 300 aa  298  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  53.26 
 
 		 295 aa  285  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  51.33 
 
 		 311 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  52.05 
 
 		 297 aa  281  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  50 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  51.59 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  48.97 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  45.49 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  50 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  42.81 
 
 		 318 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  43.39 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  41.33 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  39.25 
 
 		 398 aa  195  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  47.23 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  46.64 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  47.06 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  47.32 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  45.49 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  45.49 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  46.9 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  40.48 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  45.29 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  45.78 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  45.73 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  44.87 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  47 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  47.91 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  44.4 
 
 		 287 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  43.97 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  44.39 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  43.64 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  44.87 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  43.1 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  35.74 
 
 		 499 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  34.86 
 
 		 542 aa  75.9  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  30.65 
 
 		 530 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  33.88 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  30.43 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  35.59 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  32.57 
 
 		 536 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  33.14 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  30.29 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  32.57 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  30.46 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  28.31 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  30.73 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  32 
 
 		 534 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  30.41 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  31.79 
 
 		 529 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  30.73 
 
 		 515 aa  69.3  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  30.1 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3349  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  29.26 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.819934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  32 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03190  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  28.8 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000140956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  29.3 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  29.84 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0896  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  30.69 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7373899999999996e-31 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  29.41 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  29.26 
 
 		 514 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  32.57 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  30.41 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  33.52 
 
 		 551 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  32.07 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  32.57 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  29.78 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1091  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  32.12 
 
 		 569 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  27.91 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  30.9 
 
 		 529 aa  66.6  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  28.76 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  29.8 
 
 		 542 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  31.43 
 
 		 510 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  29.48 
 
 		 510 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  30.39 
 
 		 531 aa  65.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  29.29 
 
 		 548 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  27.6 
 
 		 527 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0969  acetyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit beta  33.59 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>