More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2801 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 
315 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  93.02 
 
 
315 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  93.02 
 
 
315 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  93.02 
 
 
315 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  92.7 
 
 
315 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  93.02 
 
 
315 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  93.02 
 
 
315 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  93.02 
 
 
315 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  72.19 
 
 
307 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  70.26 
 
 
334 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  70.2 
 
 
309 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  70.2 
 
 
309 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  69.28 
 
 
311 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  70.59 
 
 
311 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  69.28 
 
 
310 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  66.23 
 
 
306 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  65.56 
 
 
309 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  65.23 
 
 
306 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  64.29 
 
 
310 aa  348  7e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  65.1 
 
 
310 aa  345  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  63.64 
 
 
310 aa  345  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  62.5 
 
 
309 aa  342  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  64.13 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  54.67 
 
 
300 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  57.88 
 
 
302 aa  309  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  54.25 
 
 
311 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  51.05 
 
 
295 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  53.69 
 
 
297 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  54.83 
 
 
292 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  53.9 
 
 
305 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  55.94 
 
 
300 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  54.33 
 
 
291 aa  258  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  42.66 
 
 
295 aa  242  7e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  41.85 
 
 
318 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  43.45 
 
 
318 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  43.49 
 
 
318 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 
398 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  46.4 
 
 
283 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  43.15 
 
 
296 aa  178  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  43.46 
 
 
292 aa  178  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  44.35 
 
 
283 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  46.19 
 
 
300 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  42.34 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  42.34 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  46.34 
 
 
294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  46.4 
 
 
283 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  41.03 
 
 
282 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  40.43 
 
 
380 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  44.35 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  39.19 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  43.97 
 
 
287 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  43.53 
 
 
287 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  42.24 
 
 
277 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  43.72 
 
 
277 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  42.17 
 
 
283 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  40.31 
 
 
277 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  36.99 
 
 
290 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  38.29 
 
 
499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  31.5 
 
 
530 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  29.18 
 
 
541 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  31.31 
 
 
529 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  29.81 
 
 
537 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  33.33 
 
 
534 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  29.86 
 
 
534 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1796  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  31.28 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  29.44 
 
 
522 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  29.71 
 
 
510 aa  69.3  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  30.91 
 
 
542 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  31.52 
 
 
536 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  30.56 
 
 
477 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  30.63 
 
 
527 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03190  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  28.35 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000140956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  30.63 
 
 
527 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2413  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  30.21 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000493188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  28.74 
 
 
532 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3279  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  29.5 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  27.48 
 
 
514 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  28 
 
 
508 aa  67  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  31.67 
 
 
517 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  32.6 
 
 
524 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  28.98 
 
 
529 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  28.25 
 
 
514 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  28.57 
 
 
514 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  30.43 
 
 
531 aa  65.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0881  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.5 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  30.48 
 
 
512 aa  65.9  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  28.83 
 
 
527 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  28 
 
 
510 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  29.14 
 
 
510 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2370  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  28.57 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00172685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  28.98 
 
 
510 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  30.27 
 
 
532 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  27.23 
 
 
538 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  28.31 
 
 
530 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  28.57 
 
 
510 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  28.57 
 
 
510 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  29.51 
 
 
536 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  28.83 
 
 
527 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  27.68 
 
 
542 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  28.41 
 
 
510 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>