More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2894 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  100 
 
 		 297 aa  591  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  77.21 
 
 		 311 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  57.04 
 
 		 302 aa  315  8e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  57.62 
 
 		 295 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  56.27 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  52.41 
 
 		 300 aa  299  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  54.77 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  57.71 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  54.92 
 
 		 310 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  54.58 
 
 		 310 aa  288  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  54.98 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  54.58 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  55.32 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  54.79 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  54.79 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  54.76 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  53.06 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  55.07 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  53.9 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  51.86 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  55.67 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  54.76 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  50.85 
 
 		 309 aa  268  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  45.77 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  52.75 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  54.36 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  54.36 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  54.36 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  54.36 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  54.36 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  54.36 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  54.36 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  53.6 
 
 		 315 aa  235  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  41.53 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  41 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  43.09 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  41.04 
 
 		 398 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  43.65 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  44.08 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  44.64 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  45.04 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  40.84 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  41.63 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  41.63 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  39.44 
 
 		 287 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  45.67 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  46.15 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  43.35 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  41.8 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  42.02 
 
 		 282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  44.3 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  43.4 
 
 		 283 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  40.85 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  37.55 
 
 		 380 aa  158  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  37.55 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  41.59 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  37.25 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  33.86 
 
 		 499 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  34.48 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  31.74 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  32.16 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  30.54 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  28.51 
 
 		 516 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  33.15 
 
 		 524 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  30.2 
 
 		 522 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  32.18 
 
 		 510 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  32.18 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  34.44 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  34.48 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  31.31 
 
 		 530 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  34.27 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  35.56 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  32.97 
 
 		 549 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  34.25 
 
 		 531 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  34.48 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  33.89 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  32.95 
 
 		 517 aa  69.3  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  32.58 
 
 		 527 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  30.26 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  34.08 
 
 		 527 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  31.25 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  31.03 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  31.03 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  29.3 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  30.17 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  29.96 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  29.96 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  31.48 
 
 		 531 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  31.49 
 
 		 517 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  32.4 
 
 		 526 aa  67  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  32.96 
 
 		 519 aa  66.6  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  33.15 
 
 		 529 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  31.03 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.58 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0590  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  30.82 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1152  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  31.91 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.573328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  30.29 
 
 		 523 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  33.52 
 
 		 527 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  29.3 
 
 		 527 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  31.07 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>