More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3657 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  100 
 
 
380 aa  775    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  58.82 
 
 
281 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  58.82 
 
 
281 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  58.8 
 
 
283 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  56.27 
 
 
292 aa  312  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  59.93 
 
 
286 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  56.18 
 
 
283 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  66.52 
 
 
282 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  58.43 
 
 
283 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  60.29 
 
 
277 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  60.07 
 
 
277 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  56.93 
 
 
287 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  52.35 
 
 
296 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  56.55 
 
 
287 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  64.32 
 
 
282 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  60.59 
 
 
277 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  54.65 
 
 
300 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  54.1 
 
 
294 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  58.05 
 
 
283 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  48.86 
 
 
290 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  34.57 
 
 
398 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  39.82 
 
 
311 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  40.09 
 
 
295 aa  167  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  42.38 
 
 
300 aa  166  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  40.37 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  41.13 
 
 
310 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  41.29 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  39.29 
 
 
292 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  37.7 
 
 
318 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  37 
 
 
295 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  40.48 
 
 
302 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  41.51 
 
 
310 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  37.55 
 
 
297 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  38.36 
 
 
318 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  39.27 
 
 
291 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  39.65 
 
 
302 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  40.89 
 
 
307 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  38.46 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  41.25 
 
 
306 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  41.25 
 
 
306 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  40.82 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  40.82 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  37.55 
 
 
318 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  39.77 
 
 
334 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  43.24 
 
 
311 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  42.73 
 
 
311 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  40.82 
 
 
310 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  38.62 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  39.27 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  40.43 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  40 
 
 
315 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  40.61 
 
 
315 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  40 
 
 
315 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  40 
 
 
315 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  40 
 
 
315 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  40 
 
 
315 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  40 
 
 
315 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  28.8 
 
 
499 aa  90.1  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2596  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  31.82 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2608  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  31.82 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0772282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2508  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  31.82 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2717  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  31.82 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339712  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2554  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  31.82 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02241  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.81 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  30.81 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02201  hypothetical protein  30.81 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2610  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.81 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2467  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.81 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1336  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.81 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3456  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.81 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2472  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.81 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2694  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.81 
 
 
304 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3332  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  31.05 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176388  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2865  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.3 
 
 
301 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1422  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.81 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1531  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.81 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0359  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.81 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5085  malonate decarboxylase subunit delta  38.78 
 
 
101 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.241533  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10300  malonate decarboxylase subunit delta  38.54 
 
 
99 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00121331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2574  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  35.04 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1370  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  31.31 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325011  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4941  malonate decarboxylase acyl carrier protein  39.18 
 
 
101 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0738205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3865  malonate decarboxylase acyl carrier protein  39.18 
 
 
101 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1467  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.51 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4819  malonate decarboxylase subunit delta  35.92 
 
 
104 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030528  normal  0.0215828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1846  malonate decarboxylase subunit delta  35.92 
 
 
104 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.431164  normal  0.0404894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2798  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.51 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.408856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33750  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  28.27 
 
 
559 aa  69.7  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  30.17 
 
 
516 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  30.17 
 
 
516 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0948  malonate decarboxylase subunit delta  37.76 
 
 
107 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.798455  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34190  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.12 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2715  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.12 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0885934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4591  malonate decarboxylase subunit delta  35.48 
 
 
97 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0365  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  30 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06018  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase beta subunit  27.19 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5085  malonate decarboxylase, delta subunit  36.46 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  30.3 
 
 
536 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2440  malonate decarboxylase subunit delta  35.71 
 
 
99 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0411324  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3765  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.58 
 
 
297 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>