More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0048 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 310 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  93.55 
 
 		 310 aa  545  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  93.23 
 
 		 310 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  86.77 
 
 		 306 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  86.77 
 
 		 306 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  79.12 
 
 		 309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  69.87 
 
 		 311 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  69.74 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  69.7 
 
 		 307 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  71.14 
 
 		 309 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  71.14 
 
 		 309 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  69.8 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  68.98 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  67.52 
 
 		 310 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  70.33 
 
 		 302 aa  355  6.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  66.78 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  66.78 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  66.78 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  66.78 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  66.78 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  66.78 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  66.78 
 
 		 315 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  58.19 
 
 		 300 aa  330  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  57.8 
 
 		 295 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  65.1 
 
 		 315 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  57.54 
 
 		 302 aa  319  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  54.58 
 
 		 297 aa  305  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  54.33 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  53.66 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  52.74 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  53.68 
 
 		 300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  54.2 
 
 		 291 aa  258  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  44.56 
 
 		 295 aa  248  9e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  40.95 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  42.58 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  43.45 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  41.35 
 
 		 398 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  45.71 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  46.43 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  47.75 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  47.32 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  41.13 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  46.08 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  43.58 
 
 		 282 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  43.86 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  43.86 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  46.54 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  44.35 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  43.61 
 
 		 283 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  39 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  41.67 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  43.78 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  43.53 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  43.36 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  43.29 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  40.47 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  44.39 
 
 		 283 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  37.65 
 
 		 499 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  34.53 
 
 		 529 aa  85.9  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  36.61 
 
 		 542 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  37.57 
 
 		 526 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  32.42 
 
 		 541 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.28 
 
 		 546 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  36.26 
 
 		 536 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.47 
 
 		 532 aa  82.8  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  31.45 
 
 		 534 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  35.29 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  32.88 
 
 		 527 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  33.18 
 
 		 527 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  33.19 
 
 		 524 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  34.63 
 
 		 531 aa  80.1  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  33.5 
 
 		 530 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  32.59 
 
 		 543 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  30.71 
 
 		 529 aa  79.3  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  34.26 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  30.91 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  32.57 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  32.29 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  31.65 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  32.88 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  32.88 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  32.91 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  32.22 
 
 		 516 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  33.95 
 
 		 518 aa  76.3  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  32.27 
 
 		 510 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  34.97 
 
 		 536 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.51 
 
 		 527 aa  76.3  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  30.51 
 
 		 552 aa  76.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  34.07 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  32.57 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  28.98 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  31.22 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  29.41 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  32.27 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  32.1 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  31.8 
 
 		 516 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  31.16 
 
 		 514 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  29.8 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  31.69 
 
 		 551 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  32.2 
 
 		 514 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>