More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4928 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 286 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  70.04 
 
 		 292 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  67.39 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  69.2 
 
 		 287 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  69.57 
 
 		 287 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  67.03 
 
 		 283 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  66.05 
 
 		 281 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  66.05 
 
 		 281 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  65.2 
 
 		 283 aa  342  5.999999999999999e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  68.12 
 
 		 283 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  68.22 
 
 		 282 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  64.98 
 
 		 282 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  67.66 
 
 		 277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  65.54 
 
 		 277 aa  318  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  59.93 
 
 		 380 aa  318  7.999999999999999e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  64.79 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  60.97 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  60.81 
 
 		 300 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  59.5 
 
 		 294 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  55.13 
 
 		 290 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  43.75 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  41.96 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  41.2 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  41.76 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  46.41 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  43.75 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  41.38 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  44.3 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  44.5 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  41.67 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  41.92 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  41.37 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  46.59 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  44.95 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  47 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  45.16 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  45.16 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  44.13 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  44.13 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  43.72 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  44.49 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  43.95 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  44.69 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  43.86 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  43.05 
 
 		 306 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  42.67 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  43.36 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  40.35 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  44.35 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  43.56 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  43.56 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  43.56 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  43.56 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  43.56 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  43.56 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  43.56 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  33.05 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  34.18 
 
 		 499 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  33.52 
 
 		 477 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1263  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  33.16 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  32.4 
 
 		 516 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  32.4 
 
 		 516 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2554  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.51 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2508  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.51 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2608  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.51 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0772282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2717  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.51 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2596  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.51 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06018  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase beta subunit  31.61 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02241  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.98 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  32.98 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2467  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.98 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  30.96 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3456  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.98 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  34.21 
 
 		 517 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2694  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.98 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2610  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.98 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1336  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.98 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02201  hypothetical protein  32.98 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2472  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.98 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1467  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.63 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  31.76 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3349  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  28.93 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.819934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  32.56 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  34.22 
 
 		 515 aa  69.3  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2798  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.64 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.408856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2077  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  30.57 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  33.89 
 
 		 527 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  33.15 
 
 		 541 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0896  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  28.93 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7373899999999996e-31 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  31.94 
 
 		 522 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  33.69 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  30.6 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2574  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  35.77 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  32.22 
 
 		 514 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1422  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.05 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1370  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.51 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1531  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  30.05 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  31.02 
 
 		 516 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3537  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  29.63 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3279  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  28.72 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>