More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1079 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  62.54 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  59.66 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  55.89 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  57.04 
 
 		 297 aa  315  8e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  52.78 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  58.1 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  56.9 
 
 		 305 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  57.54 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  57.79 
 
 		 291 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  57.19 
 
 		 310 aa  295  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  57.19 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  57.19 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  57.89 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  57.89 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  56.49 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  57.19 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  55.97 
 
 		 334 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  56.14 
 
 		 306 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  57.5 
 
 		 302 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  56.01 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  56.84 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  53.82 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  66.01 
 
 		 300 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  58.27 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  55.05 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  56.79 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  56.79 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  56.79 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  56.79 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  56.79 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  56.79 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  56.43 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  49.37 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  43.69 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  48.74 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  42.8 
 
 		 398 aa  205  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  47.42 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  48.1 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  43.66 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  43.95 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  40 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  40 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  42.09 
 
 		 277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  45.71 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  40.83 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  44.16 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  41.92 
 
 		 286 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  42.92 
 
 		 282 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  40.33 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  46.15 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  45.7 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  41.7 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  42.86 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  39.65 
 
 		 380 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  41.9 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  36.29 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  37.04 
 
 		 534 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  30.08 
 
 		 536 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.62 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  34.22 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  31.89 
 
 		 529 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  33.51 
 
 		 524 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  32.97 
 
 		 529 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  31.35 
 
 		 530 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  31.69 
 
 		 530 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  32.07 
 
 		 543 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  31.15 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  33.86 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.18 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  29.77 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  29.51 
 
 		 559 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  33.15 
 
 		 532 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  33.15 
 
 		 527 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  30.81 
 
 		 526 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  30.6 
 
 		 540 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  29.44 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  30.05 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  33.15 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  30.81 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  31.18 
 
 		 552 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  29.44 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  29.44 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  32.09 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  30.22 
 
 		 538 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03190  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  27.51 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000140956  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  28.89 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  30.43 
 
 		 556 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  30.43 
 
 		 556 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  30.43 
 
 		 556 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  30.16 
 
 		 531 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  30.69 
 
 		 518 aa  69.7  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  31.52 
 
 		 551 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  26.67 
 
 		 522 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  29.28 
 
 		 510 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  31.28 
 
 		 531 aa  69.3  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  28.42 
 
 		 510 aa  69.3  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  30.46 
 
 		 518 aa  69.3  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  30.22 
 
 		 542 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>