More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4818 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 294 aa  587  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  92.33 
 
 		 300 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  82.19 
 
 		 296 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  60.37 
 
 		 283 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  60.58 
 
 		 281 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  60.58 
 
 		 281 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  57.04 
 
 		 292 aa  318  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  60.74 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  58.15 
 
 		 290 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  63.53 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  63.67 
 
 		 287 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  59.93 
 
 		 277 aa  299  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  60.87 
 
 		 283 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  58.28 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  62.45 
 
 		 277 aa  290  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  54.1 
 
 		 380 aa  290  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  61.51 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  59.19 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  58.57 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  62.06 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  44.81 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  44.58 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  49.55 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  49.78 
 
 		 309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  49.78 
 
 		 309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  49.33 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  48.28 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  42.45 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  44.44 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  43.7 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  43.35 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  42.63 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  48.64 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  45.19 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  44.34 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  40.95 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  48.39 
 
 		 310 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  45.69 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  46.49 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  44.3 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  45.33 
 
 		 306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  45.53 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  48.23 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  45.61 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  37.34 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  46.19 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  39.84 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  41.15 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  45.78 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  45.78 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  45.78 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  45.78 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  45.78 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  45.78 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  45.78 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  45.78 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  33.2 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  30.6 
 
 		 499 aa  92.8  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  33.04 
 
 		 541 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  36.11 
 
 		 516 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  36.11 
 
 		 516 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  32.27 
 
 		 522 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  33.93 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2508  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.87 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2596  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.87 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2554  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.87 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2717  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.87 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2608  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.87 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0772282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  32.73 
 
 		 542 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02241  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.36 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  34.36 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334325  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3456  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.36 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1336  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.36 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2694  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.36 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2467  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.36 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2610  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.36 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02201  hypothetical protein  34.36 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2472  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.36 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  32.88 
 
 		 552 aa  79  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  29.76 
 
 		 513 aa  79  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  32.16 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  33.94 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  31.25 
 
 		 536 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2865  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.85 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  33.51 
 
 		 530 aa  75.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  33.86 
 
 		 530 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  29.39 
 
 		 527 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  33.48 
 
 		 527 aa  75.5  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1422  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.85 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1531  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.85 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.11 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0359  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.85 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3332  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.85 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1467  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  36.69 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.29 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  32.28 
 
 		 524 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  32.78 
 
 		 532 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  32.43 
 
 		 546 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  32.97 
 
 		 531 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  33.51 
 
 		 529 aa  72.8  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>