More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4018 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 300 aa  597  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  62.54 
 
 		 302 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  58.48 
 
 		 295 aa  332  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  54.18 
 
 		 295 aa  325  7e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  58.97 
 
 		 292 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  58.54 
 
 		 310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  58.19 
 
 		 310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  52.19 
 
 		 311 aa  308  9e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  59.21 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  58.13 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  57 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  58.3 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  56.46 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  58.19 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  56.83 
 
 		 309 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  56.46 
 
 		 309 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  56.46 
 
 		 309 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  52.41 
 
 		 297 aa  299  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  56.1 
 
 		 291 aa  295  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  55.1 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  55.78 
 
 		 311 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  54.42 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  58.04 
 
 		 300 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  53.66 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  55.64 
 
 		 302 aa  279  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  56.88 
 
 		 315 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  55.94 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  55.94 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  55.94 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  55.94 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  55.94 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  55.94 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  55.59 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  43.96 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  45.45 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  44.33 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  42.86 
 
 		 398 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  48.03 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  45.96 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  47.16 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  44.35 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  44.35 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  46.38 
 
 		 283 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  43.08 
 
 		 287 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  44.08 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  46.05 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  40.86 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  44.3 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  43.75 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  45.11 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  39.39 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  38.83 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  41.95 
 
 		 277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  40.37 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  39.58 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  41.78 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  41.31 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  34.11 
 
 		 499 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  32.92 
 
 		 530 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  34.55 
 
 		 517 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  33.69 
 
 		 538 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  29.59 
 
 		 477 aa  89.7  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  33.74 
 
 		 524 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.94 
 
 		 537 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  33.67 
 
 		 512 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 514 aa  85.9  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  31.69 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  33.51 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  29.8 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  32.62 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  32.45 
 
 		 536 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  31.07 
 
 		 531 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  35.83 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  32.22 
 
 		 527 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  33.52 
 
 		 510 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  32.57 
 
 		 510 aa  82.4  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1342  carboxyl transferase  32.58 
 
 		 511 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525317  normal  0.223983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  33.86 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  30.23 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  31.67 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  32.39 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  32.02 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  34.57 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  31.8 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  31.46 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  32.4 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  32.44 
 
 		 518 aa  81.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  30.94 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  30.43 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  33.15 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  28.83 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  29.75 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  34.25 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  31.91 
 
 		 559 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  31.47 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  31.43 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  34.05 
 
 		 516 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  32.2 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  32.2 
 
 		 514 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  31.43 
 
 		 510 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>