More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1342 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1342  carboxyl transferase  100 
 
 
511 aa  1055    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525317  normal  0.223983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  60.08 
 
 
518 aa  619  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  57.67 
 
 
515 aa  619  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  57.48 
 
 
515 aa  617  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  59.84 
 
 
516 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  55.43 
 
 
522 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  55.23 
 
 
517 aa  586  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  55.43 
 
 
528 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  57.68 
 
 
514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  55.66 
 
 
512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  56.76 
 
 
508 aa  579  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  57.14 
 
 
522 aa  578  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  56.49 
 
 
516 aa  580  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  54.67 
 
 
512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  54.09 
 
 
514 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  55.79 
 
 
517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  55.23 
 
 
516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  52.72 
 
 
514 aa  568  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  53.59 
 
 
513 aa  565  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  54.43 
 
 
516 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  56.38 
 
 
550 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  54.64 
 
 
516 aa  561  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  54.09 
 
 
510 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  53.67 
 
 
531 aa  558  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  51.94 
 
 
516 aa  558  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  55.47 
 
 
516 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  51.46 
 
 
523 aa  554  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  54.25 
 
 
521 aa  553  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  54.83 
 
 
513 aa  551  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  49.22 
 
 
524 aa  552  1e-156  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  55.51 
 
 
513 aa  548  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  54.67 
 
 
518 aa  551  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  52.04 
 
 
510 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  50.78 
 
 
516 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  51.16 
 
 
516 aa  548  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  50.97 
 
 
516 aa  546  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  55.67 
 
 
516 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  55.37 
 
 
519 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  52.68 
 
 
522 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  52.92 
 
 
510 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  53.09 
 
 
510 aa  545  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  52.48 
 
 
531 aa  543  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  53.11 
 
 
510 aa  545  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  53.92 
 
 
513 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  52.32 
 
 
514 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  54 
 
 
520 aa  542  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  54 
 
 
519 aa  543  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  52.74 
 
 
516 aa  542  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  51.84 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  51.85 
 
 
513 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  53.25 
 
 
513 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  52.92 
 
 
530 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  52.53 
 
 
510 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  51.65 
 
 
520 aa  541  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  53.27 
 
 
518 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  51.07 
 
 
510 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  51.76 
 
 
519 aa  535  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  53.69 
 
 
510 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  54.1 
 
 
519 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  53.89 
 
 
519 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  52.72 
 
 
510 aa  538  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  53.47 
 
 
530 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  53.89 
 
 
519 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  51.95 
 
 
510 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  52.33 
 
 
514 aa  536  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  52.74 
 
 
516 aa  536  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  52.99 
 
 
559 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  52.45 
 
 
517 aa  535  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  52.85 
 
 
536 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  53.91 
 
 
524 aa  532  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  51.85 
 
 
529 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  52.14 
 
 
564 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  52.04 
 
 
510 aa  531  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  51.17 
 
 
514 aa  531  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  52.53 
 
 
510 aa  534  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  51.74 
 
 
510 aa  534  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  51.64 
 
 
510 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  52.75 
 
 
511 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  48.25 
 
 
515 aa  529  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  53.39 
 
 
512 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  51.27 
 
 
513 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  50.59 
 
 
514 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  51.02 
 
 
517 aa  529  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  51.79 
 
 
514 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  52.87 
 
 
510 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  51.46 
 
 
514 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  51.07 
 
 
510 aa  528  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  53.8 
 
 
534 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  53.48 
 
 
520 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  51.75 
 
 
510 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  51.36 
 
 
510 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  53.07 
 
 
513 aa  527  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  50 
 
 
522 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  51.75 
 
 
510 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  51.46 
 
 
510 aa  522  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  52.24 
 
 
510 aa  522  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  52.79 
 
 
546 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  51.55 
 
 
537 aa  522  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  50.58 
 
 
518 aa  522  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  50.88 
 
 
527 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>