More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1161 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 307 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  92.88 
 
 		 309 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  92.88 
 
 		 309 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  97.07 
 
 		 311 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  91.21 
 
 		 311 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  91.78 
 
 		 334 aa  534  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  90.49 
 
 		 310 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  69.93 
 
 		 309 aa  387  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  74.3 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  72.35 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  72.7 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  71.72 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  71.38 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  70.93 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  74.3 
 
 		 315 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  74.3 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  74.3 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  73.94 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  74.3 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  74.3 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  74.3 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  74.3 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  70.59 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  58.13 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  53.25 
 
 		 311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  57.19 
 
 		 302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  54.98 
 
 		 297 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  54.91 
 
 		 295 aa  298  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  54.06 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  52.33 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  51.41 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  53.97 
 
 		 291 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  42.86 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  41.75 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  43.18 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  48.33 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  45.9 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  38.72 
 
 		 398 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  48.21 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  45.68 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  47.19 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  46.52 
 
 		 281 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  46.52 
 
 		 281 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  41.99 
 
 		 300 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  48.36 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  44.57 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  47.28 
 
 		 282 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  40.88 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  46.48 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  40.89 
 
 		 380 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  47.58 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  47.83 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  47.58 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  45.16 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  45.78 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  46.09 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  43.42 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  37.89 
 
 		 499 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  34.02 
 
 		 530 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  37.64 
 
 		 542 aa  93.6  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  37.64 
 
 		 536 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  32.35 
 
 		 530 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  35.14 
 
 		 477 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  33.49 
 
 		 529 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  35.83 
 
 		 526 aa  90.1  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  30.57 
 
 		 514 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  32.91 
 
 		 527 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  31.49 
 
 		 543 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  35.59 
 
 		 534 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  36.05 
 
 		 510 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  32.73 
 
 		 524 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  30.51 
 
 		 546 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  35.2 
 
 		 529 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  35.2 
 
 		 531 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  32 
 
 		 514 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  34.66 
 
 		 541 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  34.25 
 
 		 532 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  35.96 
 
 		 527 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  35.96 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  31.6 
 
 		 527 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  31.67 
 
 		 515 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  34.68 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  30.96 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  33.71 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 518 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  32.95 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  34.29 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  30.57 
 
 		 527 aa  83.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  34.1 
 
 		 510 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  34.83 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  34.1 
 
 		 510 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  35.33 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  30.5 
 
 		 542 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  33.71 
 
 		 510 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  34.66 
 
 		 513 aa  82.8  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  33.7 
 
 		 529 aa  82.8  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  31.73 
 
 		 534 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  34.48 
 
 		 510 aa  82.4  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>