More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1484 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 315 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 315 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 315 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 315 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 315 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 315 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  99.68 
 
 		 315 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  93.02 
 
 		 315 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  72.67 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  70.92 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  71.33 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  71.33 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  69.93 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  70.59 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  69.28 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  68.54 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  67.88 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  66.89 
 
 		 306 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  67.79 
 
 		 310 aa  358  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  66.78 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  65.26 
 
 		 310 aa  355  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  64.14 
 
 		 309 aa  348  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  55.34 
 
 		 311 aa  315  9e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  64.09 
 
 		 302 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  55 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  56.46 
 
 		 302 aa  301  9e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  54.36 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  51.74 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  55.52 
 
 		 292 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  55.25 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  55.36 
 
 		 291 aa  266  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  55.94 
 
 		 300 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  41.61 
 
 		 295 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  41.85 
 
 		 318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  41.85 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  40.89 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 		 398 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  44.78 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  43.57 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  44.02 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  44.59 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  44.83 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  42.35 
 
 		 281 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  42.35 
 
 		 281 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  44.86 
 
 		 294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  43.53 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  39.73 
 
 		 282 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  43.91 
 
 		 282 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  40.61 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  43.97 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  43.53 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  43.04 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  42.67 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  41.29 
 
 		 277 aa  159  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  39.92 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  34.66 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  41.37 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  39.46 
 
 		 499 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  27.86 
 
 		 541 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  30.5 
 
 		 530 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  31.11 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  30.81 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  33.88 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  32.97 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  27.96 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  30.29 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  24.92 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  28.94 
 
 		 534 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  26.46 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  32.22 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  30.98 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  30.57 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03190  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  28.35 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000140956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  29.2 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  30.8 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  29.1 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  31 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  28.57 
 
 		 523 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  29.05 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  28.57 
 
 		 529 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  29.38 
 
 		 510 aa  66.2  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  28.57 
 
 		 522 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  29.48 
 
 		 510 aa  66.2  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  27.47 
 
 		 530 aa  65.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  29.14 
 
 		 510 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  29.89 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  28.65 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  27.8 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  29.48 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  28.65 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2413  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  30.6 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000493188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  29.55 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  28.98 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  30.65 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  29.31 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  29.31 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  28.98 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  28.96 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  28.57 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  29.71 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>