More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2437 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 477 aa  975    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  42.57 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  42.02 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  41.14 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  40.44 
 
 		 518 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  41.7 
 
 		 515 aa  372  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  41.3 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  40 
 
 		 512 aa  363  2e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  41.38 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  39.36 
 
 		 513 aa  360  4e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  39.43 
 
 		 508 aa  358  9.999999999999999e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  38.03 
 
 		 517 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  40.36 
 
 		 517 aa  357  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  40.37 
 
 		 519 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  40.33 
 
 		 520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  37.88 
 
 		 514 aa  352  5.9999999999999994e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  39.19 
 
 		 514 aa  352  7e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  39.1 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  39.8 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  39.51 
 
 		 519 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  38.09 
 
 		 528 aa  350  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  39.4 
 
 		 564 aa  350  4e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  39.51 
 
 		 519 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  39.2 
 
 		 513 aa  348  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  39.31 
 
 		 519 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  39.96 
 
 		 516 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  38.34 
 
 		 522 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  39.1 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  38.71 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  38.49 
 
 		 517 aa  343  2.9999999999999997e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  38.97 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  37.35 
 
 		 519 aa  341  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  38.12 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  38.98 
 
 		 513 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  38.09 
 
 		 550 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0796  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  37.32 
 
 		 518 aa  338  9.999999999999999e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  39.1 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  37.35 
 
 		 510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  37.63 
 
 		 510 aa  336  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  37.68 
 
 		 518 aa  336  5.999999999999999e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  38.21 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  39.24 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  37.1 
 
 		 510 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  37.35 
 
 		 510 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  38.02 
 
 		 510 aa  333  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  37.9 
 
 		 510 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  37.15 
 
 		 510 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  39.24 
 
 		 510 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  37.42 
 
 		 510 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  39.24 
 
 		 510 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  37.15 
 
 		 510 aa  332  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  37.75 
 
 		 510 aa  332  9e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  37.98 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  38.13 
 
 		 527 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  37.3 
 
 		 510 aa  331  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  37.3 
 
 		 510 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  37.68 
 
 		 510 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  37.32 
 
 		 510 aa  330  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  36.97 
 
 		 513 aa  330  4e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  38.9 
 
 		 530 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  37.1 
 
 		 510 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  36.9 
 
 		 510 aa  328  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  36.36 
 
 		 521 aa  329  9e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  37.1 
 
 		 510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  36.79 
 
 		 529 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  37.33 
 
 		 510 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  37.12 
 
 		 522 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  37.14 
 
 		 517 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  36.73 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  36.99 
 
 		 531 aa  327  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  35.37 
 
 		 516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  37.93 
 
 		 527 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  37.35 
 
 		 513 aa  326  6e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  37.12 
 
 		 512 aa  326  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  37.72 
 
 		 526 aa  325  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  36.75 
 
 		 510 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  37.95 
 
 		 510 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  36.05 
 
 		 516 aa  323  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  38.31 
 
 		 529 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  36.18 
 
 		 514 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  36.71 
 
 		 510 aa  323  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  35.94 
 
 		 510 aa  323  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  37.2 
 
 		 519 aa  322  7e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  36.97 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  36.84 
 
 		 518 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  35.83 
 
 		 513 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  36.31 
 
 		 510 aa  321  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  37.78 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  35.16 
 
 		 531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  36.07 
 
 		 531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45886  predicted protein  37.58 
 
 		 581 aa  320  3e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  37.17 
 
 		 542 aa  320  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  36.98 
 
 		 534 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  37.27 
 
 		 510 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  35.89 
 
 		 510 aa  320  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  37.27 
 
 		 510 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  36.71 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  34 
 
 		 517 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  37.8 
 
 		 508 aa  317  2e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  35.66 
 
 		 509 aa  317  2e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>