More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0287 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0287  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000945828  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1967  ribosomal protein L4/L1e  65.17 
 
 
204 aa  266  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000013321  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0085  50S ribosomal protein L4  61.58 
 
 
204 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000177628  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0035  50S ribosomal protein L4  60.59 
 
 
204 aa  241  5e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000501134  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0060  50S ribosomal protein L4  59.61 
 
 
204 aa  236  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  3.0492e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1031  50S ribosomal protein L4  57.79 
 
 
204 aa  234  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000585543  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0354  50S ribosomal protein L4  58.62 
 
 
204 aa  232  3e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000523614  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1703  50S ribosomal protein L4  56.28 
 
 
204 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603664  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1874  50S ribosomal protein L4  55.78 
 
 
204 aa  224  7e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00023713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2080  50S ribosomal protein L4  55.28 
 
 
204 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.00000000000375647  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  40.2 
 
 
207 aa  135  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  40 
 
 
208 aa  126  3e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  39.15 
 
 
206 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  36.73 
 
 
207 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  38.97 
 
 
208 aa  121  7e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
206 aa  121  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  38.22 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  39.55 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  39.06 
 
 
207 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  38.1 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  36.22 
 
 
207 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  42.44 
 
 
207 aa  117  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  37.7 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  36.69 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  37.56 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  36.76 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  34.85 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  36.76 
 
 
207 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0427  50S ribosomal protein L4  44.22 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154423  decreased coverage  0.00000614317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  39.55 
 
 
208 aa  115  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  40.11 
 
 
210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0296  ribosomal protein L4/L1e  35.29 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  35.78 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  37.17 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  42.77 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  38.92 
 
 
207 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  33.51 
 
 
204 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  33.51 
 
 
204 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  36.04 
 
 
212 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  38.38 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  33.84 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  39.15 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  37.63 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  37.75 
 
 
208 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  36.87 
 
 
222 aa  111  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  32.99 
 
 
206 aa  111  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  36.36 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  42.77 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  36.84 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0257  50S ribosomal protein L4  32.84 
 
 
206 aa  111  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000112537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  36.79 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  36.79 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  37.76 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3794  50S ribosomal protein L4  33.33 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  40.49 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  36.06 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  36.65 
 
 
206 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  41.56 
 
 
247 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  41.45 
 
 
221 aa  109  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1341  ribosomal protein L4/L1e  36.84 
 
 
210 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  34 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  42.7 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  37.08 
 
 
217 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4912  50S ribosomal protein L4  32.84 
 
 
206 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000142333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3442  50S ribosomal protein L4  33.83 
 
 
206 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000201119  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf442  50S ribosomal protein L4  39.01 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  36.7 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  36.27 
 
 
207 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0406  50S ribosomal protein L4  32.14 
 
 
205 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159199  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  36.27 
 
 
207 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  35.59 
 
 
208 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  42.14 
 
 
210 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  33.16 
 
 
205 aa  107  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  35.61 
 
 
215 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4320  ribosomal protein L4/L1e  37.5 
 
 
204 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  41.38 
 
 
209 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  41.21 
 
 
212 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0392  50S ribosomal protein L4  32.34 
 
 
206 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000956612  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  35.68 
 
 
208 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23800  50S ribosomal protein L4  36.06 
 
 
312 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00446  50S ribosomal protein L4  46.21 
 
 
201 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000113118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  36 
 
 
216 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  36.72 
 
 
212 aa  105  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0339  50S ribosomal protein L4  30.85 
 
 
206 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198449  decreased coverage  0.000274158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  39.1 
 
 
245 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  37.16 
 
 
208 aa  104  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  34.74 
 
 
207 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0204  50S ribosomal protein L4  31.34 
 
 
206 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0279  50S ribosomal protein L4  31.34 
 
 
206 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000793566  hitchhiker  0.00000000126953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1866  50S ribosomal protein L4  37.95 
 
 
213 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0257015  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1265  50S ribosomal protein L4  30.85 
 
 
206 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000518808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>