151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3311 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3311  peptidase M50  100 
 
 		 254 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107098  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3543  peptidase M50  94.49 
 
 		 265 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3906  peptidase M50  51.88 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0674  peptidase M50  51.19 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4056  peptidase M50  46.56 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0230  peptidase M50  50 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.074479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0507  peptidase M50  48.81 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0518  peptidase M50  48.81 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0496  peptidase M50  48.81 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0867338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2333  peptidase M50  44.81 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10364  integral membrane protein  46.85 
 
 		 259 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215218  normal  0.790846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31080  Zn-dependent protease  40.83 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3906  peptidase M50  37.16 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4173  peptidase M50  41.23 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.917374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0488  putative peptidase  37.01 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3959  peptidase M50  41.2 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6332  peptidase M50  47.13 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000444849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  33.87 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  32.32 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5642  peptidase M50  34.25 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.723367 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  36.31 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  27.86 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  30.81 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  30.34 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  30.34 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  31.49 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  34.64 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  31.79 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  33.55 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  31.58 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  30.2 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  31.32 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  31.58 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  32.11 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  32.11 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  31.58 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  30.86 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  36.3 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  31.58 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  35.06 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  34.07 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  34.95 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  31.25 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  34.81 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  29.61 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  34.22 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  33.14 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  30.46 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  31.25 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2032  peptidase M50  31.87 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.999243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  30.2 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  31.75 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  31.75 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  30.68 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  30.05 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  31.05 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  30.06 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  31.49 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  32.39 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  30.05 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  30.05 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  29.34 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  33.15 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  31.25 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1172  peptidase M50  28.57 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.346735  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  33.12 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  30.9 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  32.35 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  30.65 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  33.14 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  32.35 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1365  peptidase M50  32.67 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.572687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  30.11 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  32.35 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  34.44 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  32.35 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  31.49 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  32.35 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  32.35 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  32.35 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.44 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  32.58 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  33.11 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  29.27 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  33.33 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  30.15 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  30.46 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  28.43 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  29.53 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  32.39 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3670  peptidase M50  27.48 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614041  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  28.43 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  28.43 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  29.78 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  27.53 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  30.88 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  32.22 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  28.43 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  27.23 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  31.11 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>