146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4173 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4173  peptidase M50  100 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.917374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31080  Zn-dependent protease  53.08 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3906  peptidase M50  44.7 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0674  peptidase M50  42.91 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4056  peptidase M50  42.22 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2333  peptidase M50  40.27 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0230  peptidase M50  41.3 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.074479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6332  peptidase M50  53.11 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000444849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10364  integral membrane protein  42.47 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215218  normal  0.790846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3959  peptidase M50  41.36 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0507  peptidase M50  41.59 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0518  peptidase M50  41.59 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0496  peptidase M50  41.59 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0867338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3543  peptidase M50  42.98 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3311  peptidase M50  41.67 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107098  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0488  putative peptidase  37.72 
 
 		 283 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3906  peptidase M50  30.73 
 
 		 358 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  35.05 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  35 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  28.96 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  35.43 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  37.5 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  30.27 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  32.1 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  32.69 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  28.5 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  32.69 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  31.07 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  37.86 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  32.69 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  32.05 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  32.05 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  32.05 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  32.05 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  32.05 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  32.05 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  33.94 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  36.13 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  26.13 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  31.58 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  28 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  32.45 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  30.32 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1365  peptidase M50  30 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.572687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  35 
 
 		 221 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  29.08 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  28.09 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  28.09 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  33.33 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  30.67 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  29.14 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  31.9 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  29.71 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  33.33 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  32.1 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  34.38 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  31.29 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  30.86 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  36.94 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  31.82 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  29.76 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  36.49 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  32.12 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  30.67 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  30.67 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  30.67 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  27.17 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  31.58 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  29.89 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  30.06 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  29.83 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  30.06 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5642  peptidase M50  28.25 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.723367 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  31.11 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  32.91 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  31.11 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  36.36 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  32.89 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  33.74 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  30.06 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  28.4 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  30.13 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  30.06 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  33.33 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  41.76 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  27.96 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  29.45 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1115  peptidase M50  32.21 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0417957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  32.26 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  29.45 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  29.45 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  29.45 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  29.45 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  28.66 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  32.26 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  29.53 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0843  peptidase M50  31.16 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  29.05 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  33.33 
 
 		 209 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  28.86 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>