190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1834 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  82.3 
 
 		 226 aa  380  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  75.77 
 
 		 226 aa  348  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  75.66 
 
 		 226 aa  347  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  74.78 
 
 		 226 aa  341  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  68.28 
 
 		 225 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  63.11 
 
 		 225 aa  278  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  55.31 
 
 		 247 aa  248  8e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  44.55 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  48.31 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  48.31 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  45.58 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  48.06 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  43.52 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  43.93 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  43.93 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  43.04 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  44.44 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  44.44 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  48.48 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  44.44 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  44.44 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  41.59 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  41.59 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  41.59 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  41.28 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  40.65 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  42.2 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  51.37 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  43.72 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  40.37 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  42.16 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  41.98 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  42.86 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  45.21 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  43.28 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  40.65 
 
 		 220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  40.65 
 
 		 220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  42.49 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  42.49 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  49.73 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  40.48 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  40.48 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  46.7 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  44.24 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  46.41 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  40.09 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  44.39 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  39.72 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  46.03 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  40.89 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  45.96 
 
 		 223 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  42.36 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  40.38 
 
 		 220 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  39.25 
 
 		 221 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  39.25 
 
 		 221 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  39.25 
 
 		 221 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  39.25 
 
 		 221 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  39.25 
 
 		 221 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  43.18 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  41.43 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  38.79 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  40.48 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  42.51 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  41.89 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  42.72 
 
 		 213 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  41.94 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  37.56 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  41.58 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  39.36 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  41.8 
 
 		 200 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  39.58 
 
 		 202 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  40.55 
 
 		 216 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  36.79 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  47.8 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  43.98 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  36.79 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  46.93 
 
 		 207 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  40.89 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  37.7 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  42.49 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  37.17 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  37.17 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  36.27 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  37.17 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  37.17 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  44.77 
 
 		 198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  37.17 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1624  peptidase M50  41.76 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  38.02 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  37.17 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  37.02 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  41.58 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  37.02 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  37.63 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  36.65 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  43.09 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  36.65 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  36.65 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  39.23 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>