184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1365 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1365  peptidase M50  100 
 
 
217 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.572687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2032  peptidase M50  56.42 
 
 
226 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.999243  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  40.84 
 
 
223 aa  138  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  41.99 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  40 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  41.99 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  41.99 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  41.99 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  42.54 
 
 
224 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  42.54 
 
 
224 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  40.78 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  40.78 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  41.44 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  43.56 
 
 
215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  40.88 
 
 
224 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  37.5 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  40.33 
 
 
224 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  40.31 
 
 
218 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  39.66 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  39.44 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  41.4 
 
 
204 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  38.81 
 
 
216 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  39.68 
 
 
225 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  40.61 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  42.61 
 
 
207 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  39.8 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  38.92 
 
 
209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  42.58 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  37.99 
 
 
226 aa  118  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  36.08 
 
 
213 aa  118  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  35.36 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  41.51 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  36.27 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  39.47 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  44.1 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  40.11 
 
 
214 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  42.58 
 
 
222 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  40.74 
 
 
226 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  35.64 
 
 
209 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  43.16 
 
 
224 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  36.87 
 
 
226 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  43.51 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  34.93 
 
 
225 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  43.83 
 
 
218 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  38.6 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  37.57 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  40.56 
 
 
205 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  34.92 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  39.02 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  37.84 
 
 
225 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  38.42 
 
 
225 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  37.35 
 
 
200 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  36.36 
 
 
214 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  39.29 
 
 
219 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  39.29 
 
 
219 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5642  peptidase M50  33.89 
 
 
229 aa  104  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.723367 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  38.82 
 
 
246 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  39.51 
 
 
235 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  36.6 
 
 
224 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  36.82 
 
 
223 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  39.76 
 
 
205 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  39.67 
 
 
224 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  37.57 
 
 
228 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  39.02 
 
 
222 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  37.24 
 
 
222 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  40.48 
 
 
222 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3670  peptidase M50  37.24 
 
 
256 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  35.16 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  36.56 
 
 
220 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  36.56 
 
 
220 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  36.56 
 
 
220 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  39.39 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  36.76 
 
 
220 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  40.76 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  38.38 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  35.2 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  34.04 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  34.38 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  38.24 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  39.39 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  34.04 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  35.19 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  37.89 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  34.08 
 
 
228 aa  95.5  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  36.47 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  35.68 
 
 
220 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  36.47 
 
 
220 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  34.54 
 
 
221 aa  94.7  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  34.02 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  35.36 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  34.02 
 
 
221 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  38.24 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0843  peptidase M50  32.68 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  34.02 
 
 
221 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  34.02 
 
 
221 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  34.02 
 
 
221 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  34.02 
 
 
221 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  42.41 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  40.25 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  33.16 
 
 
222 aa  92  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>