173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1624 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  100 
 
 
225 aa  433  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  44.8 
 
 
220 aa  191  7e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  45.93 
 
 
224 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  42.34 
 
 
221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  39.19 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  45.71 
 
 
219 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  45.71 
 
 
219 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  44.55 
 
 
213 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  42.08 
 
 
220 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  42.58 
 
 
216 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  41.94 
 
 
226 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  40.5 
 
 
228 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  41.15 
 
 
219 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  41.15 
 
 
219 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  40.27 
 
 
227 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  41.2 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  40.91 
 
 
205 aa  146  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  37.79 
 
 
232 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  41.28 
 
 
202 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  36.54 
 
 
224 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  38.5 
 
 
224 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  39.73 
 
 
219 aa  141  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  41.94 
 
 
214 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  40.28 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  40.58 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  41.55 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  42.06 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  40.58 
 
 
224 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  40.58 
 
 
224 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  40.1 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  40.1 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  40.1 
 
 
224 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  40.1 
 
 
224 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  40.1 
 
 
224 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  41.75 
 
 
223 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  40.1 
 
 
224 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  40.1 
 
 
224 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  42.29 
 
 
218 aa  136  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  41.12 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  40.91 
 
 
222 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  37.96 
 
 
226 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0843  peptidase M50  37.84 
 
 
215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  38.1 
 
 
239 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  40.69 
 
 
222 aa  134  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  38.84 
 
 
203 aa  134  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  38.89 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  37.04 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  37.95 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  39.91 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  39.51 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  38.97 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  42.54 
 
 
227 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  36 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  40.19 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  38.31 
 
 
214 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  41.44 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  38.76 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  38.36 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  38.94 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  39.49 
 
 
223 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  39.9 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  39.9 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  39.9 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  39.9 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  39.9 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  38.46 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  41.18 
 
 
234 aa  128  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  39.39 
 
 
220 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  39.39 
 
 
221 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  39.49 
 
 
220 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  35.43 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  39.39 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  39.3 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  35.43 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  40.1 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  37.95 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  40.1 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  38.39 
 
 
226 aa  126  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  36.65 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3670  peptidase M50  39.27 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  42.64 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  39.8 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  43.96 
 
 
224 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  39.02 
 
 
260 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  40.45 
 
 
234 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  38.38 
 
 
220 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  38.38 
 
 
220 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  38.38 
 
 
220 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  38.01 
 
 
221 aa  124  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  41.03 
 
 
235 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  43.3 
 
 
224 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  37.95 
 
 
220 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  37.67 
 
 
225 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  37.44 
 
 
220 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  34.36 
 
 
214 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  36.52 
 
 
225 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  39.29 
 
 
228 aa  122  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  37.44 
 
 
220 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1172  peptidase M50  43.07 
 
 
214 aa  121  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.346735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  39.9 
 
 
224 aa  121  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>