167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2551 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  100 
 
 
220 aa  433  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  99.55 
 
 
220 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  87.67 
 
 
220 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  81 
 
 
221 aa  360  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  81.9 
 
 
221 aa  360  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  81.45 
 
 
221 aa  358  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  81.45 
 
 
221 aa  358  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  81.45 
 
 
221 aa  358  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  81.45 
 
 
221 aa  358  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  81.45 
 
 
221 aa  358  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  78.18 
 
 
220 aa  351  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  78.08 
 
 
220 aa  351  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  78.18 
 
 
220 aa  351  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  78.18 
 
 
220 aa  351  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  77.73 
 
 
220 aa  347  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  77.27 
 
 
220 aa  346  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  76.82 
 
 
220 aa  342  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  64.09 
 
 
221 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  65.45 
 
 
222 aa  293  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  63.18 
 
 
221 aa  292  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  64.09 
 
 
221 aa  291  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  62.27 
 
 
221 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  61.99 
 
 
222 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  66.35 
 
 
222 aa  279  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  62.61 
 
 
223 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  60.45 
 
 
222 aa  268  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  62.21 
 
 
228 aa  268  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  62.21 
 
 
228 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  62.67 
 
 
260 aa  262  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  56.94 
 
 
225 aa  252  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  59.53 
 
 
239 aa  252  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1624  peptidase M50  55.41 
 
 
227 aa  245  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  56.74 
 
 
220 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  52.61 
 
 
219 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  51.57 
 
 
234 aa  191  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  47.32 
 
 
219 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  47.32 
 
 
219 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  55.12 
 
 
216 aa  184  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  50 
 
 
227 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  52.55 
 
 
213 aa  180  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  49.47 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  51.02 
 
 
219 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  51.02 
 
 
219 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  47.37 
 
 
218 aa  174  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  49.02 
 
 
205 aa  167  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  46.84 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  46.84 
 
 
230 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2460  peptidase M50  50.7 
 
 
217 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754633  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  49.43 
 
 
234 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  49.46 
 
 
223 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  39.71 
 
 
226 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  48.92 
 
 
223 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  44.34 
 
 
225 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  50.84 
 
 
224 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  43.84 
 
 
233 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  46.15 
 
 
235 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  40.48 
 
 
226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  48.85 
 
 
227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  41.75 
 
 
226 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  41.74 
 
 
247 aa  148  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  40.28 
 
 
226 aa  148  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  41.71 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  40.85 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  45.98 
 
 
228 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  41.38 
 
 
213 aa  138  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  43.48 
 
 
221 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  47.4 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  41.28 
 
 
223 aa  128  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  35.82 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  40.89 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  41.67 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  41.71 
 
 
203 aa  126  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  38.33 
 
 
232 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  37.44 
 
 
224 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  41.97 
 
 
231 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  34.88 
 
 
224 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  39.38 
 
 
209 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  40.19 
 
 
207 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  40.31 
 
 
226 aa  122  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  35.71 
 
 
220 aa  122  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  38.35 
 
 
202 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  39.78 
 
 
225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  36.52 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  36.19 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  39.79 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  41.94 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  43.02 
 
 
246 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  34.56 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  33.48 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  39.09 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  33.48 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  37.85 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  34.47 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  33.48 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  34.47 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  33.48 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  33.48 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  35.71 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  33.19 
 
 
224 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  40.66 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>