165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1172 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1172  peptidase M50  100 
 
 
214 aa  420  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.346735  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  55.87 
 
 
216 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  56.25 
 
 
218 aa  222  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0843  peptidase M50  47.64 
 
 
215 aa  202  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1115  peptidase M50  43.95 
 
 
227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0417957  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  40.99 
 
 
225 aa  132  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  41.58 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  40.28 
 
 
220 aa  125  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  38.65 
 
 
209 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  41.55 
 
 
219 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  42.77 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  37.31 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  38.81 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  38.66 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  38.66 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  36.27 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  36.89 
 
 
220 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  40.31 
 
 
220 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  39.27 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  37.24 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  38.22 
 
 
220 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  38.22 
 
 
220 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  38.22 
 
 
220 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  36.71 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  36.15 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  39.29 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  38.83 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  37.31 
 
 
226 aa  113  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  37.86 
 
 
220 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  38.22 
 
 
220 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  38.36 
 
 
207 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  41.71 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  35.68 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  35.96 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  37.07 
 
 
222 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  34.33 
 
 
224 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  36.95 
 
 
220 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  37.91 
 
 
228 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  37.76 
 
 
221 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  37.91 
 
 
228 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  39.06 
 
 
223 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  38.83 
 
 
213 aa  111  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  37.32 
 
 
221 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  37.7 
 
 
220 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  37.76 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  37.76 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  37.76 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  37.76 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  37.76 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  37.02 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  33.83 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  33.83 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  35.86 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  37.06 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  41.36 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  35.12 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  34.55 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  35.12 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  33.83 
 
 
224 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  36.04 
 
 
221 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  33.83 
 
 
224 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  33.83 
 
 
224 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  39.39 
 
 
218 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  37.32 
 
 
221 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  40.1 
 
 
216 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  38.19 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  37.25 
 
 
220 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  38.73 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  34.76 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  37.07 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  39.38 
 
 
200 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  36.53 
 
 
225 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  36.79 
 
 
224 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  39.29 
 
 
222 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  37.86 
 
 
221 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  34.56 
 
 
260 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  37.75 
 
 
203 aa  104  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  33.33 
 
 
223 aa  104  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  35.65 
 
 
226 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  34.4 
 
 
225 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  41.56 
 
 
227 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  36.45 
 
 
226 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  38.55 
 
 
222 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  36.45 
 
 
226 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  38.55 
 
 
222 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  34.85 
 
 
202 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3670  peptidase M50  34.58 
 
 
256 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614041  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  34.97 
 
 
228 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  32.69 
 
 
227 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  42.86 
 
 
234 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  35.8 
 
 
214 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  36.26 
 
 
228 aa  101  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  40 
 
 
198 aa  99  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  33.33 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  38.89 
 
 
239 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  41.61 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  37.19 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  35.38 
 
 
224 aa  95.5  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  35.18 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>