173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1132 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  100 
 
 
246 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  44.44 
 
 
225 aa  158  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  42.33 
 
 
228 aa  142  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  42.86 
 
 
235 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  44.3 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  39.22 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  37.77 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  40.72 
 
 
220 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  44.97 
 
 
205 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  43.46 
 
 
231 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  38.46 
 
 
228 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  41.76 
 
 
220 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  36.22 
 
 
219 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  36.22 
 
 
219 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  39.89 
 
 
221 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  43.02 
 
 
232 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  36.65 
 
 
222 aa  122  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  38.86 
 
 
218 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  38.2 
 
 
223 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  39.34 
 
 
221 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  39.02 
 
 
220 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  40 
 
 
228 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  40 
 
 
228 aa  122  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  36.79 
 
 
226 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  38.8 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  39.18 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  38.8 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  38.8 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  38.8 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  38.8 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  40.1 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  38.89 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  39.58 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  39.18 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  39.58 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  39.58 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  41.24 
 
 
224 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  42.33 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  38.46 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  38.17 
 
 
225 aa  119  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  36.79 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  37.95 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  39.23 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  39.38 
 
 
218 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  35.15 
 
 
216 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  37.63 
 
 
222 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  38.82 
 
 
222 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3670  peptidase M50  35.71 
 
 
256 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614041  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  40.66 
 
 
221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  38.46 
 
 
221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  42.14 
 
 
221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  43.02 
 
 
220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  41.36 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  39.49 
 
 
203 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  42.44 
 
 
220 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  37.62 
 
 
226 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  40.74 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  37.91 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  40.11 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  40.28 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  39.53 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  35.15 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  34.42 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  38.71 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  36.71 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  32.12 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  40.48 
 
 
233 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  41.3 
 
 
214 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  35.18 
 
 
224 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  33.67 
 
 
224 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  36.27 
 
 
225 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  33.03 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  33.49 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  40.74 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  35.2 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  43.23 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  34.6 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  38.24 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  32.16 
 
 
224 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  32.16 
 
 
224 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  36.47 
 
 
222 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  33.33 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  33.33 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  39.26 
 
 
218 aa  109  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  32.16 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  32.16 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  32.16 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  32.16 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  38.65 
 
 
234 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  33.85 
 
 
230 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  33.95 
 
 
245 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  37.06 
 
 
222 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  38.12 
 
 
247 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  38.12 
 
 
224 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0843  peptidase M50  35.42 
 
 
215 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  34.21 
 
 
230 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  40.26 
 
 
225 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1624  peptidase M50  38.36 
 
 
227 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  36.62 
 
 
207 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  40.37 
 
 
224 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>