189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1961 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  100 
 
 
226 aa  450  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  82.3 
 
 
226 aa  380  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  75.55 
 
 
226 aa  346  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  73.01 
 
 
226 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  71.68 
 
 
226 aa  330  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  68.72 
 
 
225 aa  300  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  61.88 
 
 
225 aa  275  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  54.42 
 
 
247 aa  244  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  49.76 
 
 
219 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  49.76 
 
 
219 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  45.5 
 
 
219 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  47.2 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  46.34 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  44.66 
 
 
222 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  46.57 
 
 
218 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  45.85 
 
 
228 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  45.85 
 
 
228 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  51.15 
 
 
213 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  46.61 
 
 
223 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  48.34 
 
 
234 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  43.95 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  43.95 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  48.06 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  43.69 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  43.06 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  43.38 
 
 
227 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  42.72 
 
 
220 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  42.72 
 
 
220 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  42.72 
 
 
220 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  44.55 
 
 
220 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  45.54 
 
 
233 aa  158  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  41.78 
 
 
220 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  42.08 
 
 
216 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  43.41 
 
 
222 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  43 
 
 
221 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  45.41 
 
 
222 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  45.5 
 
 
221 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  44.79 
 
 
230 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  40.38 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  42.23 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  44.27 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  44.85 
 
 
205 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  44.97 
 
 
221 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  44.97 
 
 
221 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  44.97 
 
 
221 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  44.97 
 
 
221 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  44.97 
 
 
221 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  41.75 
 
 
220 aa  151  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  38.68 
 
 
224 aa  151  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  43.43 
 
 
207 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  41.38 
 
 
209 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  49.18 
 
 
227 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  41.75 
 
 
221 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  44.74 
 
 
220 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  44.44 
 
 
221 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  42.86 
 
 
239 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  41.71 
 
 
220 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  44.21 
 
 
220 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  44.19 
 
 
213 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  50.27 
 
 
234 aa  148  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  42.4 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  40 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  43.54 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  45.5 
 
 
224 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  47.21 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  42.36 
 
 
220 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  47.47 
 
 
223 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  42.19 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  39.15 
 
 
221 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1624  peptidase M50  45.6 
 
 
227 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  37.44 
 
 
220 aa  141  7e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  42.11 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  41.58 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  47.37 
 
 
207 aa  138  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  37.37 
 
 
214 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  42.93 
 
 
235 aa  136  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  40.69 
 
 
223 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  47.09 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  42.33 
 
 
200 aa  135  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  48.9 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  45.03 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  40.87 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  39.44 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  43.46 
 
 
224 aa  131  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  35.55 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  35.07 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  35.07 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  35.07 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  36.36 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  35.07 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  35.07 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  35.07 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  35.07 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  35.07 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  39.06 
 
 
222 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2460  peptidase M50  40.28 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754633  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  36.7 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  42.93 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  38.16 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  39.79 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>