168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2981 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  100 
 
 
215 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  43.41 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  43 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  41.67 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  41.67 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  39.89 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  39.89 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  38.59 
 
 
209 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  41.15 
 
 
224 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  41.15 
 
 
224 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  41.15 
 
 
224 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  41.15 
 
 
224 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1365  peptidase M50  39.58 
 
 
217 aa  124  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.572687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  40.62 
 
 
224 aa  124  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  39.04 
 
 
224 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  39.59 
 
 
224 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  39.43 
 
 
211 aa  121  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  38.94 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  40.49 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  40.68 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  39.79 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  34.2 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  37.64 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  42.76 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2032  peptidase M50  42.22 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.999243  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  37.85 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  40.98 
 
 
214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  39.35 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  35.38 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  42.42 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  36.99 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  38.03 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  39.55 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  35.83 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  33.67 
 
 
226 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  37.13 
 
 
200 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  37.33 
 
 
228 aa  104  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  37.13 
 
 
221 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  35.9 
 
 
226 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  34.43 
 
 
219 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  34.43 
 
 
219 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  39.66 
 
 
213 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  44.97 
 
 
204 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  39.13 
 
 
247 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  41.44 
 
 
223 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  40.91 
 
 
220 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  40.91 
 
 
220 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  35.94 
 
 
225 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  37.93 
 
 
226 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  40.91 
 
 
220 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  39.59 
 
 
205 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  37.75 
 
 
220 aa  101  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  41.55 
 
 
209 aa  101  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  37.57 
 
 
226 aa  101  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  36.27 
 
 
214 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  38.15 
 
 
222 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  38.15 
 
 
222 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  37.13 
 
 
218 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  38.19 
 
 
219 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  37.72 
 
 
213 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  34.33 
 
 
224 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  40.7 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  38.07 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  33.33 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  42.77 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  40.34 
 
 
220 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  41.07 
 
 
226 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  42.17 
 
 
222 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  40.34 
 
 
220 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  35.36 
 
 
225 aa  98.2  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  32.67 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  31.77 
 
 
245 aa  97.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  39.44 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  37.7 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  36.23 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  36.32 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  38.89 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  37.57 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  38.89 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  38.89 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  38.89 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  33.33 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  38.89 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  37.13 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  31.72 
 
 
260 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  38.33 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  40.23 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  36.93 
 
 
239 aa  95.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  36.94 
 
 
237 aa  94.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  36.14 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  37.58 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  38.04 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  38.32 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  35.03 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  36.14 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  38.41 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  38.41 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  37.22 
 
 
221 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  35.71 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  33.33 
 
 
226 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>