214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2248 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  100 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  91.48 
 
 		 223 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  79.91 
 
 		 224 aa  314  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  59.28 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  65.52 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  64.74 
 
 		 226 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  54.92 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  52.45 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  50.23 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  50.23 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  56.92 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  56.92 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  51.34 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  53.48 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  51.46 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  53.19 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  52.26 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  53.01 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  53.01 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  50 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  54.44 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  50.49 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  50.49 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  50.49 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  50.49 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  50.49 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  51.83 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  51.58 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  53.33 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  51.31 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  50.79 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  50.8 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  47.45 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  50.26 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  48.39 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  53.33 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  47.85 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  47.47 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  50 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  46.03 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  46.97 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  47.85 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  47.31 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  47.31 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  47.31 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  47.31 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  44.97 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  52.6 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  48.39 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  48.48 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  47.98 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  48.48 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  53.16 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  47.37 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  46.73 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1624  peptidase M50  52.25 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  49.24 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  52.15 
 
 		 213 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  50.79 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  48.69 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  50.84 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  49.74 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  48 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  46.91 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  48.94 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  44.13 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  40.3 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  43.3 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  42.08 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  42.46 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  41.85 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2460  peptidase M50  47.89 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  41.27 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  42.25 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  38.14 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  44.15 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  37.5 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  43.72 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  47.8 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  47.8 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  42.61 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  44.81 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  45.56 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  48.09 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  44.69 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  45.05 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  39.68 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  42.45 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0843  peptidase M50  41.06 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  43.08 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  43.86 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  46.54 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  46.15 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  45.73 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  41.76 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  42.13 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  39.68 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  40.11 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  40.11 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  40.11 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>