27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0488 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0488  putative peptidase  100 
 
 		 283 aa  553  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3906  peptidase M50  43.4 
 
 		 358 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3906  peptidase M50  35.63 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4056  peptidase M50  36.36 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3543  peptidase M50  36.69 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3311  peptidase M50  37.01 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107098  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0674  peptidase M50  37.05 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0230  peptidase M50  35.83 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.074479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0507  peptidase M50  40.64 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0518  peptidase M50  40.64 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0496  peptidase M50  40.64 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0867338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10364  integral membrane protein  35.42 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215218  normal  0.790846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4173  peptidase M50  33.53 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.917374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2333  peptidase M50  30.84 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31080  Zn-dependent protease  33.33 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3959  peptidase M50  29.13 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6332  peptidase M50  32.26 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000444849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  28.96 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  28.22 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  25.15 
 
 		 213 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  33.11 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  27.49 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  25.54 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  26.54 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  26.54 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  29.14 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  29.89 
 
 		 200 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>