146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3959 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3959  peptidase M50  100 
 
 
259 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3906  peptidase M50  40.23 
 
 
267 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4056  peptidase M50  38.75 
 
 
276 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10364  integral membrane protein  42.13 
 
 
259 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215218  normal  0.790846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0674  peptidase M50  39.92 
 
 
259 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0507  peptidase M50  40.23 
 
 
259 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0518  peptidase M50  40.23 
 
 
259 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0496  peptidase M50  40.23 
 
 
259 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0867338  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4173  peptidase M50  41.36 
 
 
252 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.917374  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0230  peptidase M50  37.35 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.074479  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2333  peptidase M50  36.98 
 
 
281 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31080  Zn-dependent protease  43.26 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3311  peptidase M50  39.36 
 
 
254 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107098  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3543  peptidase M50  40 
 
 
265 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6332  peptidase M50  41.4 
 
 
226 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000444849  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3906  peptidase M50  41.22 
 
 
358 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  32.49 
 
 
223 aa  85.9  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  35.52 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  32.11 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  31.34 
 
 
224 aa  79  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  31.34 
 
 
224 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  32.11 
 
 
224 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  32.11 
 
 
224 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  29.76 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  32.11 
 
 
224 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0488  putative peptidase  29.18 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  34.13 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  31.65 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  33.01 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  33.01 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  32.58 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  31.72 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  30.81 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  30.81 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  31.28 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  34.62 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  34.21 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  35.47 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  34.97 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  26.07 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  35.43 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  33.77 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  29.63 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  32.45 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  29.87 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  29.52 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  36.99 
 
 
213 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  31.79 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  28.88 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  31.75 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  37.42 
 
 
201 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  35 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  35 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  33.7 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  31.61 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  29.23 
 
 
226 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  36.42 
 
 
224 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  29.67 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  31.14 
 
 
230 aa  62.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  27.69 
 
 
226 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  31.48 
 
 
218 aa  62.4  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  29.38 
 
 
222 aa  62  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5642  peptidase M50  33.33 
 
 
229 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.723367 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  31.74 
 
 
230 aa  62.4  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  28.81 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  29.05 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  31.61 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  29.91 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  31.34 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  30.3 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  27.81 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  36.25 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  35.17 
 
 
214 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  29.11 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  27.7 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1172  peptidase M50  28.42 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.346735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  31.82 
 
 
222 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  30.27 
 
 
226 aa  59.7  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  28.96 
 
 
220 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1365  peptidase M50  29.14 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.572687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  29.65 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  31.74 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  30.14 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  28.57 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  29.13 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  28.38 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  27.81 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  33.99 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  28.86 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  29.91 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  28.64 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  28.64 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  28.64 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  28.64 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  28.64 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  34.44 
 
 
223 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  29.12 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  25.64 
 
 
226 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  29.82 
 
 
200 aa  56.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  32.52 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>