115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3906 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3906  peptidase M50  100 
 
 
358 aa  693    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0488  putative peptidase  43.4 
 
 
283 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3906  peptidase M50  37.21 
 
 
267 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3543  peptidase M50  37.93 
 
 
265 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3311  peptidase M50  37.16 
 
 
254 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107098  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4056  peptidase M50  35.45 
 
 
276 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0674  peptidase M50  34.24 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10364  integral membrane protein  35.19 
 
 
259 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215218  normal  0.790846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2333  peptidase M50  30.56 
 
 
281 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0230  peptidase M50  35.29 
 
 
256 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.074479  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0507  peptidase M50  38.02 
 
 
259 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0518  peptidase M50  38.02 
 
 
259 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0496  peptidase M50  38.02 
 
 
259 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0867338  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3959  peptidase M50  41.22 
 
 
259 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4173  peptidase M50  30.73 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.917374  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31080  Zn-dependent protease  32.8 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  33.86 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  30.81 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  29.68 
 
 
223 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  36.05 
 
 
209 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  27.91 
 
 
218 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6332  peptidase M50  30.88 
 
 
226 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000444849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  32.99 
 
 
213 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  32.89 
 
 
224 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  29.41 
 
 
225 aa  59.7  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  23.62 
 
 
213 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  29.5 
 
 
224 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  29.5 
 
 
224 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  32.34 
 
 
224 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  30.21 
 
 
200 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  29 
 
 
224 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  29 
 
 
224 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  29 
 
 
224 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  29 
 
 
224 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  29.7 
 
 
226 aa  58.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  32.48 
 
 
222 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  28.72 
 
 
207 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  26.7 
 
 
219 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  26.7 
 
 
219 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  27.57 
 
 
228 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  28.5 
 
 
224 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  28.71 
 
 
224 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  28.71 
 
 
224 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  29.05 
 
 
213 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  29.01 
 
 
216 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  27.33 
 
 
245 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  28.48 
 
 
237 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  28.49 
 
 
225 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  33.12 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  31.58 
 
 
224 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  31.87 
 
 
214 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  30.07 
 
 
203 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  28.74 
 
 
228 aa  54.3  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  29.21 
 
 
224 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  30.25 
 
 
220 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  29.28 
 
 
224 aa  53.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2032  peptidase M50  30.46 
 
 
226 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.999243  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  34.78 
 
 
201 aa  53.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1365  peptidase M50  31.61 
 
 
217 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.572687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  33.11 
 
 
224 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  34.87 
 
 
215 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  30.57 
 
 
225 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  30.46 
 
 
205 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  34.36 
 
 
222 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  31.17 
 
 
224 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  26.32 
 
 
209 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  34.57 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  34.03 
 
 
204 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  27.33 
 
 
220 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5642  peptidase M50  28.72 
 
 
229 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.723367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  32.69 
 
 
205 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  26.77 
 
 
227 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  24.61 
 
 
224 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  31.08 
 
 
226 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  26.11 
 
 
218 aa  50.4  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  36.55 
 
 
198 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  31.66 
 
 
220 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  28.32 
 
 
202 aa  49.3  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  30 
 
 
216 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  28.57 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  28.57 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  24.42 
 
 
225 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  28.95 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  24.02 
 
 
214 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  27.08 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  29.48 
 
 
222 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  31.16 
 
 
220 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  31.41 
 
 
227 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  26.21 
 
 
226 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  28.12 
 
 
222 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  26.98 
 
 
235 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  29.89 
 
 
220 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  28.39 
 
 
234 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  29.65 
 
 
220 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  29.65 
 
 
220 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  29.65 
 
 
220 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  25.24 
 
 
226 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  29.26 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  30.61 
 
 
223 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  29.65 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>