128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_31080  Zn-dependent protease  100 
 
 
256 aa  495  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6332  peptidase M50  66.06 
 
 
226 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000444849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4173  peptidase M50  53.08 
 
 
252 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.917374  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4056  peptidase M50  42.86 
 
 
276 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3906  peptidase M50  44.96 
 
 
267 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0230  peptidase M50  48.29 
 
 
256 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.074479  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10364  integral membrane protein  45.89 
 
 
259 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215218  normal  0.790846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0674  peptidase M50  45.19 
 
 
259 aa  161  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0507  peptidase M50  46.63 
 
 
259 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0518  peptidase M50  46.63 
 
 
259 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0496  peptidase M50  46.63 
 
 
259 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0867338  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2333  peptidase M50  46.2 
 
 
281 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3543  peptidase M50  42.2 
 
 
265 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3959  peptidase M50  43.26 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3311  peptidase M50  41.28 
 
 
254 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107098  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3906  peptidase M50  34.22 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0488  putative peptidase  33.33 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  31.64 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  32.39 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  32.39 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  35.63 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  31.16 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  27.32 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  31.07 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  31.07 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  31.07 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  30.68 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  29.38 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  29.38 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  35.26 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  30.51 
 
 
224 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  28.95 
 
 
221 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  33.73 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  32.24 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5642  peptidase M50  30.41 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.723367 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  27.92 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  28.25 
 
 
224 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  31.41 
 
 
218 aa  62  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  32.41 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  29.51 
 
 
224 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  29.51 
 
 
224 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  28.81 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  32.96 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  32.57 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  34.93 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  29.61 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  31.35 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  29.24 
 
 
205 aa  59.7  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  33.12 
 
 
213 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  32.2 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  29.05 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  32.21 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  36.08 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  29.12 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1918  M50 family peptidase  30.17 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0658548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1636  M50 family peptidase  30.17 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0323055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  31.79 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  27.27 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  32.18 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  29.89 
 
 
222 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  36.3 
 
 
223 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  25.82 
 
 
227 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  30.16 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  29.19 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  28.57 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  30.53 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  30.15 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  25.99 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  25.42 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  29.01 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  30.64 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  30.48 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  27.72 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  33.1 
 
 
228 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  27.5 
 
 
213 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  26.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  26.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  32.64 
 
 
198 aa  52.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  26.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  30.94 
 
 
228 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  28.31 
 
 
200 aa  52.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  28.57 
 
 
228 aa  52.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  26.4 
 
 
220 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  29.89 
 
 
226 aa  52  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  28.57 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  31.79 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  29.89 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  27.72 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  26.67 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  29.12 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  29.94 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  29.48 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  27.27 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  31.21 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  35.06 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  26.11 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  31.21 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  31.21 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  31.21 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  31.21 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>