147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1636 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1918  M50 family peptidase  99.51 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0658548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1636  M50 family peptidase  100 
 
 
206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0323055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  39.77 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  37.5 
 
 
220 aa  118  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  38.67 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  38.67 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  39.06 
 
 
222 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  41.61 
 
 
225 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  39.35 
 
 
224 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  39.35 
 
 
224 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  39.35 
 
 
224 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  34.16 
 
 
213 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  39.35 
 
 
224 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  39.35 
 
 
224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  36.63 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  39.61 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  38.71 
 
 
224 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  38.71 
 
 
224 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  39.07 
 
 
198 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  38.67 
 
 
224 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  37.01 
 
 
203 aa  106  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  41.29 
 
 
202 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  31.03 
 
 
218 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  38.38 
 
 
200 aa  99  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  33.86 
 
 
226 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  34.03 
 
 
226 aa  98.6  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  36.41 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  35.67 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  31.91 
 
 
226 aa  95.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  34.19 
 
 
247 aa  95.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  34.12 
 
 
218 aa  94.7  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  40 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  31.34 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  33.76 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  35.57 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  34.15 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  36.78 
 
 
204 aa  87.8  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  28.21 
 
 
214 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  32.1 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  31.71 
 
 
226 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  37.58 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  29.88 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  30.49 
 
 
226 aa  85.5  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  30.35 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  29.65 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  29.08 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  29.15 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1365  peptidase M50  30.26 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.572687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  31.61 
 
 
222 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  31.58 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  30.61 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  32.4 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  29.91 
 
 
224 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.18 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  29.3 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  30.69 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  31.18 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  33.76 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  33.13 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  35.03 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  29.82 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  31.06 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  31.87 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  31.06 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  29.82 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  30.41 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  29.75 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  28.43 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  29.59 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  28.35 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  31.68 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  27.17 
 
 
245 aa  71.2  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  28.8 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  29.41 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  28.8 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  29.12 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  27.18 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  31.01 
 
 
239 aa  68.2  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  30.95 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  26.7 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  28.66 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  28.05 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2032  peptidase M50  27.45 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.999243  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  28.66 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  29.81 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  26.06 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  26.06 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  31.06 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  28.29 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  26.4 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  28.48 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  28.82 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  27.16 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  28.75 
 
 
227 aa  62  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  31.41 
 
 
234 aa  62  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  29.11 
 
 
224 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  26.4 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  29.23 
 
 
228 aa  61.2  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  26.38 
 
 
246 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  26.54 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>