138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6332 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6332  peptidase M50  100 
 
 		 226 aa  433  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000444849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31080  Zn-dependent protease  66.06 
 
 		 256 aa  256  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4173  peptidase M50  53.11 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.917374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4056  peptidase M50  46.49 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3906  peptidase M50  48.74 
 
 		 267 aa  158  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0230  peptidase M50  47.91 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.074479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2333  peptidase M50  43.56 
 
 		 281 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10364  integral membrane protein  46.51 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215218  normal  0.790846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0674  peptidase M50  44.39 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3959  peptidase M50  42.86 
 
 		 259 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0507  peptidase M50  45.12 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0518  peptidase M50  45.12 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0496  peptidase M50  45.12 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0867338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3543  peptidase M50  44.09 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3311  peptidase M50  41.55 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107098  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  34.78 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3906  peptidase M50  31.34 
 
 		 358 aa  85.1  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  34.24 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  34.24 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  34.24 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  33.88 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  33.7 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  33.7 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  33.7 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  34.24 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  34.24 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0488  putative peptidase  31.05 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  33.15 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  33.7 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  37.42 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  32.39 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  32.39 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  29.48 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  36.13 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  35.15 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  34.59 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  29.9 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0801  peptidase M50  28.78 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  33.51 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  28.57 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  32.85 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  29.78 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1918  M50 family peptidase  31.32 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0658548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1636  M50 family peptidase  31.32 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0323055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  32.95 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  35.05 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  30.23 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  35.86 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5642  peptidase M50  31.28 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.723367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  30.56 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1047  peptidase M50  26.9 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  33.33 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  32.74 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  36.68 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  36.88 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  31.03 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  29.23 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0830  M50 family peptidase  31.9 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.115362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  34.67 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  29.61 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  38.13 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  35.05 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  32 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  30.36 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  31.51 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  30.61 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  30.39 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1365  peptidase M50  33.99 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.572687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  32.05 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  31.28 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  34.23 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  30.77 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  29.79 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  28.9 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  28.88 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  27.53 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  33.56 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  30.81 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  30.77 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  29.52 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  28.07 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  29.49 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  26.22 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  28.32 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  30.27 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  29.81 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  29.65 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  31.91 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  31.22 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  31.48 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  32.1 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  34.39 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  31.11 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  33.96 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  31.48 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  29.38 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  32.1 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  31.97 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  31.48 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  31.48 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>