More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1524 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1524  ABC transporter related  100 
 
 		 542 aa  1072    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0146442  normal  0.0990499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5109  ABC transporter related  55.32 
 
 		 603 aa  565  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  0.98251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0011  ABC transporter related protein  45.39 
 
 		 608 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  42.93 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  42.05 
 
 		 612 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  42.76 
 
 		 614 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  42.88 
 
 		 614 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0082  ABC transporter related  42.27 
 
 		 614 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  34.38 
 
 		 607 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  36.45 
 
 		 609 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  34.95 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  37.13 
 
 		 613 aa  363  6e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  36.07 
 
 		 609 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  35.13 
 
 		 616 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  36.29 
 
 		 609 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1674  ABC transporter related  34.87 
 
 		 610 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  36.45 
 
 		 609 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  35.08 
 
 		 609 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  34.21 
 
 		 612 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  35.08 
 
 		 609 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  37.17 
 
 		 610 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 		 609 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04842  ABC transporter ATP-binding protein  37.23 
 
 		 610 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  36.12 
 
 		 609 aa  349  7e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  36.45 
 
 		 609 aa  349  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1307  ABC transporter related  36.72 
 
 		 611 aa  349  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.556896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  34.65 
 
 		 609 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2941  ABC transporter related  35.08 
 
 		 609 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.417973  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  33.83 
 
 		 622 aa  347  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2801  ABC transporter related  35.08 
 
 		 609 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0386861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  36.45 
 
 		 609 aa  346  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  36.1 
 
 		 608 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.43 
 
 		 610 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.43 
 
 		 610 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  36.45 
 
 		 610 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  37.13 
 
 		 613 aa  339  7e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  38.42 
 
 		 621 aa  336  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  36.24 
 
 		 610 aa  336  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1543  ABC transporter related  34.86 
 
 		 617 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103422 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.97 
 
 		 630 aa  333  5e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  36.05 
 
 		 618 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  36.73 
 
 		 621 aa  331  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.29 
 
 		 619 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  36.9 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  35.07 
 
 		 616 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  34.26 
 
 		 609 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 706 aa  325  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  37.7 
 
 		 646 aa  324  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  34.35 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  34.85 
 
 		 621 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  36.9 
 
 		 614 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  33.11 
 
 		 609 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.01 
 
 		 625 aa  320  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.55 
 
 		 612 aa  318  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  35.46 
 
 		 618 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  37.21 
 
 		 618 aa  316  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  37.21 
 
 		 646 aa  316  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.02 
 
 		 621 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0113  ABC transporter related  35.28 
 
 		 619 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  32.35 
 
 		 609 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.6 
 
 		 612 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1487  ABC transporter related  35.99 
 
 		 609 aa  310  4e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1740  ABC transporter related  33.44 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  37.44 
 
 		 624 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  35.74 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.21 
 
 		 617 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  37.58 
 
 		 619 aa  303  6.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2893  ABC transporter related  37.6 
 
 		 614 aa  300  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2848  ABC transporter-related protein  34.43 
 
 		 611 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.934041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2864  ABC transporter related  36.75 
 
 		 614 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  40.54 
 
 		 614 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  34.91 
 
 		 617 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2721  ABC transporter related  33.99 
 
 		 615 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  33.01 
 
 		 618 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  33.66 
 
 		 621 aa  296  8e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  34.09 
 
 		 617 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  34.09 
 
 		 617 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1203  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.56 
 
 		 614 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0276633  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  34.09 
 
 		 617 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  35.41 
 
 		 618 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2641  ABC transporter related  37 
 
 		 614 aa  293  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1214  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.1 
 
 		 609 aa  292  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.24 
 
 		 619 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2576  ABC transporter related  35.07 
 
 		 620 aa  290  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  36.04 
 
 		 619 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  33.85 
 
 		 617 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3223  ABC transporter related  35.41 
 
 		 620 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1666  ABC transporter related  36.1 
 
 		 613 aa  280  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.66549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  33.68 
 
 		 617 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  34.98 
 
 		 617 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6066  ABC transporter related  33.28 
 
 		 617 aa  277  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0549196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  36.13 
 
 		 630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2089  ABC transporter related  35.78 
 
 		 613 aa  273  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240835  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  33.28 
 
 		 658 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2240  ABC transporter related  30.87 
 
 		 626 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.34 
 
 		 615 aa  254  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2545  ABC transporter related  30.11 
 
 		 626 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  70.89 
 
 		 613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  32.92 
 
 		 599 aa  221  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  30.35 
 
 		 633 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>