More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5109 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0011  ABC transporter related protein  59.5 
 
 		 608 aa  679    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5109  ABC transporter related  100 
 
 		 603 aa  1173    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  0.98251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1524  ABC transporter related  55.32 
 
 		 542 aa  579  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0146442  normal  0.0990499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  49.34 
 
 		 614 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  48.52 
 
 		 612 aa  537  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  48.85 
 
 		 614 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  49.01 
 
 		 614 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  48.43 
 
 		 614 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0082  ABC transporter related  46.62 
 
 		 614 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  44.37 
 
 		 610 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  40.98 
 
 		 607 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  45.96 
 
 		 610 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  46.13 
 
 		 610 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  44.08 
 
 		 610 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.17 
 
 		 610 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  42.17 
 
 		 610 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04842  ABC transporter ATP-binding protein  43.68 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  44.48 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  42.18 
 
 		 609 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.16 
 
 		 610 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  41.41 
 
 		 611 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  42.67 
 
 		 610 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  43.16 
 
 		 610 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1307  ABC transporter related  44.08 
 
 		 611 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.556896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  43.16 
 
 		 610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  45.95 
 
 		 624 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  45.48 
 
 		 621 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  42.51 
 
 		 609 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  41.21 
 
 		 609 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  44.39 
 
 		 621 aa  465  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  41.46 
 
 		 609 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  44.44 
 
 		 613 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  41.04 
 
 		 609 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  42.18 
 
 		 609 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  41.14 
 
 		 609 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1235  ABC transporter related  43.46 
 
 		 610 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0197069  normal  0.341484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  41.69 
 
 		 608 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  39.87 
 
 		 616 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  42.18 
 
 		 609 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  40.2 
 
 		 612 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  43.09 
 
 		 610 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2801  ABC transporter related  41.37 
 
 		 609 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0386861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  41.85 
 
 		 609 aa  458  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  41.37 
 
 		 609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  41.67 
 
 		 622 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2941  ABC transporter related  41.37 
 
 		 609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.417973  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  42.95 
 
 		 621 aa  452  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  44.1 
 
 		 616 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 		 706 aa  449  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1674  ABC transporter related  40.92 
 
 		 610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  40.43 
 
 		 609 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  45.17 
 
 		 618 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  42.06 
 
 		 613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0113  ABC transporter related  44.32 
 
 		 619 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  41.5 
 
 		 609 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.87 
 
 		 630 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  40.88 
 
 		 613 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  40.53 
 
 		 609 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  41.69 
 
 		 609 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  42.23 
 
 		 612 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.6 
 
 		 621 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  42.83 
 
 		 622 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.85 
 
 		 619 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  41.92 
 
 		 618 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  44.54 
 
 		 621 aa  435  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.1 
 
 		 617 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.35 
 
 		 619 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  43.99 
 
 		 614 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  41.27 
 
 		 618 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.98 
 
 		 625 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  42.34 
 
 		 617 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  43.69 
 
 		 619 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  39.93 
 
 		 603 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  44.1 
 
 		 618 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  42.51 
 
 		 637 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  42.39 
 
 		 637 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1543  ABC transporter related  41.58 
 
 		 617 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2721  ABC transporter related  43.75 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  44.1 
 
 		 646 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  44.1 
 
 		 646 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1666  ABC transporter related  42.39 
 
 		 613 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.66549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  39.68 
 
 		 621 aa  424  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.8 
 
 		 612 aa  423  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 		 658 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  43.58 
 
 		 617 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  42.23 
 
 		 618 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  43.87 
 
 		 617 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  42.83 
 
 		 619 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  43.87 
 
 		 617 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2089  ABC transporter related  42.39 
 
 		 613 aa  415  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240835  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 		 630 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1203  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  43.36 
 
 		 614 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0276633  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2864  ABC transporter related  43.52 
 
 		 614 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1487  ABC transporter related  43.84 
 
 		 609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2893  ABC transporter related  42.36 
 
 		 614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2641  ABC transporter related  42.98 
 
 		 614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2576  ABC transporter related  44.35 
 
 		 620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3611  ABC transporter related  42.31 
 
 		 626 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  42.11 
 
 		 617 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1740  ABC transporter related  41.82 
 
 		 609 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>