164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2377 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  999    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2008  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.44 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 		 559 aa  210  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  31.66 
 
 		 598 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  28.36 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.38 
 
 		 547 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  32.38 
 
 		 557 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  34.15 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.37 
 
 		 565 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 558 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  31.25 
 
 		 540 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.4 
 
 		 566 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.45 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.99 
 
 		 558 aa  186  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  30.31 
 
 		 576 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.11 
 
 		 542 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.74 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  35.62 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  31.91 
 
 		 563 aa  183  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  29.34 
 
 		 615 aa  183  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.74 
 
 		 525 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.45 
 
 		 629 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.53 
 
 		 549 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.98 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.53 
 
 		 521 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  29.47 
 
 		 611 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  34.83 
 
 		 615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.83 
 
 		 615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  34.83 
 
 		 615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  34.83 
 
 		 615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  35.15 
 
 		 615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  34.83 
 
 		 615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  34.83 
 
 		 615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  30.77 
 
 		 564 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  34.06 
 
 		 512 aa  180  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  29.62 
 
 		 575 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.92 
 
 		 556 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 521 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.94 
 
 		 602 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  29.85 
 
 		 606 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.24 
 
 		 586 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 590 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 595 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.36 
 
 		 599 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  29.84 
 
 		 563 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.03 
 
 		 549 aa  177  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 472 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  30.35 
 
 		 530 aa  176  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  29.37 
 
 		 616 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  29.2 
 
 		 615 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.09 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 525 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  29.2 
 
 		 615 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  34.23 
 
 		 546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  29.2 
 
 		 615 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 461 aa  174  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  26.29 
 
 		 523 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.89 
 
 		 654 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  33.45 
 
 		 618 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  33.45 
 
 		 618 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  29.32 
 
 		 607 aa  173  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  33.45 
 
 		 596 aa  173  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.92 
 
 		 560 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  29.77 
 
 		 571 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 498 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.18 
 
 		 563 aa  170  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 399 aa  170  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.75 
 
 		 730 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  28.42 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.02 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  32.16 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  29.87 
 
 		 536 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  27.17 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.77 
 
 		 560 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.48 
 
 		 540 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.46 
 
 		 724 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.75 
 
 		 543 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.02 
 
 		 672 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.25 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.75 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  34.6 
 
 		 572 aa  167  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.12 
 
 		 540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.25 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  34.6 
 
 		 656 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.68 
 
 		 648 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  34.94 
 
 		 702 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.89 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.45 
 
 		 670 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  35.74 
 
 		 513 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.95 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  33.13 
 
 		 718 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.91 
 
 		 646 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>