162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1828 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  939    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.56 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.2 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.56 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.07 
 
 		 473 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.59 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 521 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.47 
 
 		 521 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.47 
 
 		 521 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.78 
 
 		 484 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.27 
 
 		 525 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  45.09 
 
 		 502 aa  341  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.99 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 542 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.82 
 
 		 558 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.95 
 
 		 558 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.5 
 
 		 560 aa  259  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.57 
 
 		 559 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  35.29 
 
 		 563 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.26 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  35.2 
 
 		 563 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.39 
 
 		 547 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.37 
 
 		 560 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  34.68 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  41.2 
 
 		 513 aa  216  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 560 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  33.17 
 
 		 563 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  32.93 
 
 		 576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 563 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  35.48 
 
 		 564 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  38.31 
 
 		 618 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  38.31 
 
 		 596 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  38.31 
 
 		 618 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  33.81 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  38.95 
 
 		 575 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  35.11 
 
 		 513 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.69 
 
 		 565 aa  209  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  33.93 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  37.59 
 
 		 613 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  35.79 
 
 		 530 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.46 
 
 		 560 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  35.22 
 
 		 524 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 560 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.53 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  32.17 
 
 		 611 aa  203  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.65 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  38.03 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  38.65 
 
 		 615 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  38.03 
 
 		 616 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  38.65 
 
 		 615 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  38.65 
 
 		 615 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  38.03 
 
 		 615 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  38.65 
 
 		 615 aa  202  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  38.65 
 
 		 615 aa  202  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  33.24 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  38.03 
 
 		 615 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  38.03 
 
 		 606 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  35.97 
 
 		 607 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  38.65 
 
 		 615 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  38.65 
 
 		 615 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  32.02 
 
 		 571 aa  200  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.91 
 
 		 549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.95 
 
 		 526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.04 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  31.94 
 
 		 546 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 546 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.74 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.56 
 
 		 549 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  34.59 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.75 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.98 
 
 		 599 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.97 
 
 		 566 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  33.23 
 
 		 530 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  32.01 
 
 		 536 aa  189  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 531 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 		 540 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 456 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  32.37 
 
 		 446 aa  186  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  32.37 
 
 		 433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.44 
 
 		 540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  34.2 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.27 
 
 		 540 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.41 
 
 		 545 aa  181  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.02 
 
 		 447 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  29.95 
 
 		 614 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  26.13 
 
 		 523 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.76 
 
 		 553 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.49 
 
 		 595 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.34 
 
 		 590 aa  177  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.64 
 
 		 426 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  32.38 
 
 		 568 aa  176  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.56 
 
 		 432 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.59 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 556 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  32.22 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>