166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1032 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  100 
 
 
615 aa  1261    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  99.84 
 
 
615 aa  1259    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  84.74 
 
 
616 aa  1073    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  99.35 
 
 
611 aa  1244    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  84.42 
 
 
615 aa  1067    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  84.25 
 
 
606 aa  1059    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  55.07 
 
 
576 aa  652    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  75.16 
 
 
607 aa  936    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  84.74 
 
 
615 aa  1073    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  99.67 
 
 
615 aa  1254    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1261    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  84.58 
 
 
615 aa  1071    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  53.73 
 
 
618 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1261    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  99.67 
 
 
615 aa  1256    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  58.14 
 
 
613 aa  675    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  54.98 
 
 
596 aa  669    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  56.41 
 
 
575 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  53.73 
 
 
618 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1261    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  99.51 
 
 
615 aa  1256    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  55.76 
 
 
563 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  53.72 
 
 
564 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  33.57 
 
 
513 aa  300  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  32.3 
 
 
530 aa  287  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  32.75 
 
 
512 aa  279  9e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  32.61 
 
 
524 aa  266  7e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.11 
 
 
565 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  32.39 
 
 
513 aa  250  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.5 
 
 
560 aa  246  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.75 
 
 
559 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.19 
 
 
558 aa  243  9e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.28 
 
 
549 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.19 
 
 
563 aa  243  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.95 
 
 
558 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.48 
 
 
560 aa  237  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1072  hypothetical protein  51.05 
 
 
475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.75 
 
 
542 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.09 
 
 
549 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.05 
 
 
566 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  31.6 
 
 
563 aa  230  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  31.27 
 
 
546 aa  229  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  40.62 
 
 
563 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.62 
 
 
521 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.62 
 
 
521 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.39 
 
 
547 aa  220  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.28 
 
 
521 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  39.8 
 
 
502 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.28 
 
 
525 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.79 
 
 
451 aa  217  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 
461 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.84 
 
 
472 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.37 
 
 
498 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  32.27 
 
 
419 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.93 
 
 
484 aa  212  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.73 
 
 
556 aa  212  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  39.51 
 
 
530 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  29.28 
 
 
571 aa  206  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  33.66 
 
 
536 aa  206  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.22 
 
 
473 aa  204  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.48 
 
 
599 aa  204  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  39.93 
 
 
557 aa  203  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.65 
 
 
458 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.56 
 
 
549 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.33 
 
 
560 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  37.46 
 
 
598 aa  200  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  39.31 
 
 
540 aa  200  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.52 
 
 
560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.38 
 
 
443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.22 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.57 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  36.84 
 
 
568 aa  196  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.15 
 
 
672 aa  194  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  32.61 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.33 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.86 
 
 
571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.15 
 
 
516 aa  189  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.59 
 
 
506 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  35.42 
 
 
558 aa  186  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.74 
 
 
540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.96 
 
 
540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.86 
 
 
433 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.53 
 
 
540 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  34.47 
 
 
410 aa  183  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1223  hypothetical protein  34.64 
 
 
318 aa  183  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  37.46 
 
 
537 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  34.96 
 
 
656 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.07 
 
 
545 aa  183  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  36.36 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  36.12 
 
 
410 aa  181  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  36.36 
 
 
446 aa  181  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  34.83 
 
 
483 aa  181  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  34.67 
 
 
572 aa  180  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.18 
 
 
533 aa  180  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.12 
 
 
433 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36 
 
 
433 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.36 
 
 
526 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.27 
 
 
595 aa  179  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  34.28 
 
 
661 aa  176  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.99 
 
 
535 aa  176  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>