159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0962 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1176    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  98.78 
 
 		 656 aa  1165    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  84.27 
 
 		 668 aa  1023    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  46.65 
 
 		 614 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.4 
 
 		 636 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.13 
 
 		 637 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  42.61 
 
 		 661 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  42.51 
 
 		 631 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.27 
 
 		 672 aa  249  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  31.52 
 
 		 554 aa  230  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.84 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.23 
 
 		 560 aa  227  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.5 
 
 		 559 aa  224  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.49 
 
 		 716 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.41 
 
 		 624 aa  223  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.63 
 
 		 549 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  31.93 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.83 
 
 		 547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.79 
 
 		 646 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.67 
 
 		 662 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.48 
 
 		 670 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  30.16 
 
 		 718 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.4 
 
 		 648 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  30.28 
 
 		 811 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.27 
 
 		 654 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 		 629 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.26 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  28.3 
 
 		 563 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.79 
 
 		 775 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.68 
 
 		 625 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.62 
 
 		 566 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.08 
 
 		 724 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 535 aa  201  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  32.03 
 
 		 546 aa  200  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  29.12 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.25 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.93 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  31.25 
 
 		 561 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.44 
 
 		 531 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  32.72 
 
 		 536 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 674 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  28.57 
 
 		 571 aa  193  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  30.08 
 
 		 576 aa  193  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 730 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  30.26 
 
 		 564 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.04 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 540 aa  191  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  30.47 
 
 		 702 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.69 
 
 		 560 aa  190  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  31.43 
 
 		 563 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.2 
 
 		 599 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.7 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.76 
 
 		 534 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  26.37 
 
 		 568 aa  187  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  35.54 
 
 		 618 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  35.54 
 
 		 596 aa  187  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  35.54 
 
 		 618 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  30.65 
 
 		 557 aa  186  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.99 
 
 		 549 aa  186  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.19 
 
 		 543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  36.73 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  29.85 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  35.89 
 
 		 615 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  35.89 
 
 		 615 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  34.27 
 
 		 613 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  35.89 
 
 		 606 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  35.74 
 
 		 616 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  35.89 
 
 		 615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.67 
 
 		 615 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  34.67 
 
 		 615 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  34.67 
 
 		 615 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  34.67 
 
 		 615 aa  180  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  34.67 
 
 		 615 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  34.67 
 
 		 615 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  34.67 
 
 		 615 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  34.67 
 
 		 611 aa  180  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  34.67 
 
 		 615 aa  180  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  35.35 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  30.63 
 
 		 598 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  28.37 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  27.27 
 
 		 558 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.42 
 
 		 472 aa  177  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.55 
 
 		 602 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.55 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 590 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  28.09 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  35.62 
 
 		 523 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.11 
 
 		 443 aa  174  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  32.46 
 
 		 502 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.45 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>